More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1110 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1110  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00277439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4374  response regulator receiver protein  59.88 
 
 		 174 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.45297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5208  response regulator receiver protein  50.54 
 
 		 184 aa  197  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000457636 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2889  response regulator receiver protein  52.43 
 
 		 186 aa  194  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3207  response regulator receiver protein  52.43 
 
 		 186 aa  194  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2198  response regulator receiver protein  47.09 
 
 		 192 aa  191  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3005  response regulator receiver domain-containing protein  47.12 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3494  response regulator receiver protein  50.57 
 
 		 180 aa  181  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.342019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.88 
 
 		 434 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  35.78 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 120 aa  84.3  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.86 
 
 		 589 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.22 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 434 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3956  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314568 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0289  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 1907 aa  81.6  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  32.21 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.26 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 124 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.2 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.23 
 
 		 1180 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0828  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.38 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0751  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0880271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  33.62 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.96 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  30.71 
 
 		 2284 aa  79  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  32.76 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2657  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0140925  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1618  response regulator receiver domain-containing protein  30.52 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0905  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000245258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2519  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  31.65 
 
 		 468 aa  78.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.11 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  29.73 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  29.51 
 
 		 1629 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1370  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 119 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0549  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 119 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  28.75 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2370  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  34.07 
 
 		 124 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  29.37 
 
 		 2301 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  31.36 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1556  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.37 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  31.06 
 
 		 919 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0614  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  29.01 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.33 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  34.71 
 
 		 734 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  28.86 
 
 		 352 aa  75.5  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 945 aa  75.5  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.53 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 935 aa  75.5  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  30.25 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0295  response regulator receiver protein  32.45 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  30 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  29.66 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1965  response regulatory protein, sigma 54 related  34.71 
 
 		 384 aa  75.1  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0275961  normal  0.129103 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0309  response regulator receiver protein  32.45 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 2175 aa  75.1  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 1974 aa  74.7  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 2212 aa  75.1  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 		 378 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  30.25 
 
 		 121 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 791 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  32.86 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4173  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 126 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  29.55 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  29.66 
 
 		 167 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 138 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0599  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 123 aa  74.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.44338  hitchhiker  0.0000000000672903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 2539 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 136 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 1646 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4630  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0961185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  33.04 
 
 		 1643 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 1647 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>