More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06228 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  677    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  94.31 
 
 		 334 aa  624  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  82.93 
 
 		 334 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  64.26 
 
 		 344 aa  458  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.18 
 
 		 331 aa  320  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 331 aa  315  6e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.18 
 
 		 335 aa  315  7e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.9 
 
 		 331 aa  315  9e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.86 
 
 		 331 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  45.51 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  45.27 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  45.27 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  45.27 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  45 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.27 
 
 		 331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  45.27 
 
 		 331 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  44.38 
 
 		 331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  44.38 
 
 		 331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  44.61 
 
 		 331 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  46.25 
 
 		 331 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  42.29 
 
 		 376 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  44.08 
 
 		 346 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.61 
 
 		 333 aa  279  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  42.64 
 
 		 334 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  43.24 
 
 		 334 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  41.25 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.6 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.12 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  37.43 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  35.03 
 
 		 327 aa  195  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  35.2 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  34.78 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.15 
 
 		 203 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  50.86 
 
 		 121 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 122 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  47.01 
 
 		 122 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 122 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  47.01 
 
 		 122 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  47.01 
 
 		 122 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  47.01 
 
 		 184 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 122 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 122 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 122 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 122 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 122 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  47.01 
 
 		 208 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  47.01 
 
 		 208 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 122 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 122 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  48.72 
 
 		 132 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  47.01 
 
 		 122 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.66 
 
 		 207 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  47.32 
 
 		 117 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.17 
 
 		 207 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  44.83 
 
 		 122 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  45.13 
 
 		 117 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  44.07 
 
 		 121 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  42.74 
 
 		 121 aa  102  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  43.97 
 
 		 122 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  43.97 
 
 		 122 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  43.97 
 
 		 122 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  43.97 
 
 		 122 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  43.97 
 
 		 122 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  44.35 
 
 		 121 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  24.53 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.67 
 
 		 207 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.34 
 
 		 204 aa  89.7  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 118 aa  86.3  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  28.79 
 
 		 202 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  37.07 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  32.26 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  32.26 
 
 		 207 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  32.26 
 
 		 207 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  32.26 
 
 		 207 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  32.26 
 
 		 207 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  32.26 
 
 		 207 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.35 
 
 		 211 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  32.26 
 
 		 207 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  32.26 
 
 		 207 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  35.64 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  41.51 
 
 		 120 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  33.33 
 
 		 641 aa  76.3  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1977  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.35 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.35 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.35 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.35 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.85 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2684  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 124 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 125 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 125 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 631 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  33.13 
 
 		 768 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 835 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  31.19 
 
 		 678 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.354871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  31.62 
 
 		 778 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>