More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2107 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  67.12 
 
 		 675 aa  935    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  100 
 
 		 768 aa  1510    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0092  response regulator receiver protein  58.7 
 
 		 682 aa  793    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  47.77 
 
 		 774 aa  452  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  48.32 
 
 		 768 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  47.18 
 
 		 794 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  47.7 
 
 		 772 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  46.97 
 
 		 794 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  45.21 
 
 		 796 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  45.51 
 
 		 812 aa  439  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  47.27 
 
 		 771 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  44.72 
 
 		 792 aa  435  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  47.88 
 
 		 808 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  42.61 
 
 		 810 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  46.2 
 
 		 825 aa  435  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  45.85 
 
 		 824 aa  432  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  44.03 
 
 		 816 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  45.22 
 
 		 823 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  44.03 
 
 		 817 aa  432  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  44.23 
 
 		 817 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  45.61 
 
 		 828 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  47.07 
 
 		 806 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  47.37 
 
 		 819 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  46.22 
 
 		 772 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  43.44 
 
 		 800 aa  426  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  45.6 
 
 		 835 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  47.76 
 
 		 780 aa  426  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  48.37 
 
 		 802 aa  425  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  44.34 
 
 		 775 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  44.59 
 
 		 797 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  46.22 
 
 		 768 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  47.97 
 
 		 802 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  45.4 
 
 		 835 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  45.19 
 
 		 843 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  46.85 
 
 		 810 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  45.38 
 
 		 793 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  45.64 
 
 		 813 aa  417  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  43.64 
 
 		 797 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  46.54 
 
 		 788 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  47.06 
 
 		 783 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  47.38 
 
 		 815 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  47.16 
 
 		 817 aa  414  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  44.68 
 
 		 820 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 800 aa  415  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  45.33 
 
 		 815 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  43.47 
 
 		 856 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  42.4 
 
 		 814 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  40.92 
 
 		 804 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  43.13 
 
 		 812 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  44.58 
 
 		 815 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  44.96 
 
 		 801 aa  412  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  47.36 
 
 		 786 aa  411  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  44.23 
 
 		 809 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  45.19 
 
 		 880 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  43.58 
 
 		 811 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  44.35 
 
 		 783 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  48.58 
 
 		 809 aa  412  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  45.38 
 
 		 804 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  46.38 
 
 		 813 aa  412  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  44.77 
 
 		 774 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  41.83 
 
 		 807 aa  408  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  45.83 
 
 		 788 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  45.31 
 
 		 846 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  41.48 
 
 		 798 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  45.83 
 
 		 788 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  43.36 
 
 		 898 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  44.18 
 
 		 817 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  45.59 
 
 		 775 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  44.58 
 
 		 793 aa  405  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  41.02 
 
 		 809 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  45.19 
 
 		 776 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1211  ATP-dependent protease La  43.78 
 
 		 817 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6716  ATP-dependent protease La  46.95 
 
 		 798 aa  405  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.902322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  42.19 
 
 		 787 aa  403  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  45.19 
 
 		 776 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  45.19 
 
 		 773 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  43.16 
 
 		 778 aa  405  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2695  ATP-dependent protease La  41.45 
 
 		 811 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.53 
 
 		 786 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  43.47 
 
 		 815 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  44.19 
 
 		 816 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  45.19 
 
 		 776 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  45.7 
 
 		 790 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  41.76 
 
 		 823 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  43.44 
 
 		 840 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  44.35 
 
 		 773 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  45.19 
 
 		 776 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  44.14 
 
 		 806 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  44.98 
 
 		 773 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  46.03 
 
 		 835 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  43.72 
 
 		 821 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  45.19 
 
 		 776 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  45.19 
 
 		 776 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  45.19 
 
 		 776 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  44.21 
 
 		 803 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  47.38 
 
 		 792 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  46.75 
 
 		 810 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  45.91 
 
 		 836 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  44.98 
 
 		 773 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 		 785 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>