More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2668 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  67.12 
 
 		 768 aa  916    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  100 
 
 		 675 aa  1350    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0092  response regulator receiver protein  66.82 
 
 		 682 aa  855    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  51 
 
 		 810 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  53.61 
 
 		 774 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  55.15 
 
 		 808 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  52.57 
 
 		 823 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  51.54 
 
 		 806 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  51.2 
 
 		 819 aa  475  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  50.55 
 
 		 817 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  51.32 
 
 		 812 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  50.33 
 
 		 816 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  49.67 
 
 		 771 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  51.42 
 
 		 768 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  49.35 
 
 		 794 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  49.79 
 
 		 796 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  50.33 
 
 		 817 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  49.35 
 
 		 794 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  52.13 
 
 		 797 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  50.76 
 
 		 792 aa  465  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  50.76 
 
 		 797 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  48.79 
 
 		 772 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  51.23 
 
 		 772 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  50.11 
 
 		 815 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  50.88 
 
 		 828 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  51.45 
 
 		 768 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  51.86 
 
 		 783 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  53.36 
 
 		 824 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  51.5 
 
 		 802 aa  458  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  52.21 
 
 		 825 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  50.98 
 
 		 780 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  50.77 
 
 		 835 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  52.09 
 
 		 786 aa  458  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  50.98 
 
 		 835 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  51.24 
 
 		 810 aa  458  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  50.44 
 
 		 805 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  48.32 
 
 		 816 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  51.35 
 
 		 807 aa  455  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  54.61 
 
 		 835 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  50.23 
 
 		 803 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  52.33 
 
 		 804 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  49.68 
 
 		 843 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  50 
 
 		 811 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  50.22 
 
 		 775 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  51.54 
 
 		 836 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  50.12 
 
 		 803 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  53.49 
 
 		 809 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  50.56 
 
 		 775 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  51.17 
 
 		 802 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  50.93 
 
 		 814 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  50.92 
 
 		 800 aa  451  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  49.44 
 
 		 774 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  51.39 
 
 		 815 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  48.1 
 
 		 823 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  49.66 
 
 		 773 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  50.56 
 
 		 800 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  49.66 
 
 		 776 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  49.66 
 
 		 776 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  49.89 
 
 		 776 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  50.88 
 
 		 788 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  49.66 
 
 		 776 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  49.77 
 
 		 801 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  49.66 
 
 		 773 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  49.43 
 
 		 786 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  51.08 
 
 		 786 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  48.33 
 
 		 793 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  49.2 
 
 		 784 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  52.97 
 
 		 898 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  51.79 
 
 		 856 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  49.89 
 
 		 776 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  48.49 
 
 		 773 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  47.57 
 
 		 783 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  49.89 
 
 		 776 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  49.66 
 
 		 776 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  50.88 
 
 		 788 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  49.89 
 
 		 773 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  48.55 
 
 		 778 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  48.1 
 
 		 798 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  50.24 
 
 		 785 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  48.1 
 
 		 798 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  47.86 
 
 		 785 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  48.03 
 
 		 786 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1744  ATP-dependent protease La  48.1 
 
 		 798 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484284  hitchhiker  0.00114156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  47.63 
 
 		 805 aa  445  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  49.2 
 
 		 784 aa  445  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3467  ATP-dependent protease La  48.1 
 
 		 798 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.895403  hitchhiker  0.000510926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  50.7 
 
 		 805 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  49.2 
 
 		 799 aa  445  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  48.03 
 
 		 816 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  48.08 
 
 		 785 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  48.31 
 
 		 785 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  49.2 
 
 		 784 aa  445  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  48.53 
 
 		 784 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  48.97 
 
 		 784 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  49.2 
 
 		 784 aa  445  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  45 
 
 		 804 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  50.37 
 
 		 788 aa  445  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  48.97 
 
 		 784 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  47.15 
 
 		 787 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  48.97 
 
 		 784 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>