More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6716 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  51.29 
 
 		 835 aa  760    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  45.56 
 
 		 811 aa  648    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  45.3 
 
 		 768 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  47.65 
 
 		 840 aa  684    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  44.79 
 
 		 819 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.08 
 
 		 784 aa  635    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  50.78 
 
 		 828 aa  758    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  44.62 
 
 		 809 aa  636    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  44.76 
 
 		 806 aa  646    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  45.14 
 
 		 773 aa  669    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  45.68 
 
 		 803 aa  643    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.43 
 
 		 784 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6716  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 798 aa  1596    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.902322  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  45.14 
 
 		 776 aa  670    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  45.27 
 
 		 776 aa  671    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  45.4 
 
 		 776 aa  673    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5717  ATP-dependent protease La  46.83 
 
 		 804 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.548129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.97 
 
 		 793 aa  639    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.71 
 
 		 786 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  45.04 
 
 		 804 aa  645    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  44.33 
 
 		 810 aa  680    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  44.71 
 
 		 803 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.3 
 
 		 784 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  49.22 
 
 		 788 aa  678    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  43.68 
 
 		 805 aa  635    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.08 
 
 		 793 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  43.53 
 
 		 816 aa  658    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  44.79 
 
 		 846 aa  645    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  44.53 
 
 		 798 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  45.87 
 
 		 817 aa  694    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  45.84 
 
 		 780 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  45.76 
 
 		 801 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  44.97 
 
 		 804 aa  648    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  44.63 
 
 		 773 aa  661    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  44.26 
 
 		 774 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  44.1 
 
 		 823 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  44.47 
 
 		 794 aa  658    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  46.48 
 
 		 809 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  45.01 
 
 		 773 aa  668    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  47.12 
 
 		 790 aa  648    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  43.65 
 
 		 800 aa  647    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  49.15 
 
 		 801 aa  697    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  47.51 
 
 		 768 aa  685    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.94 
 
 		 784 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  51.29 
 
 		 843 aa  759    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  44.56 
 
 		 835 aa  646    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  46.93 
 
 		 898 aa  671    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  45.95 
 
 		 825 aa  669    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  44.34 
 
 		 794 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  47.99 
 
 		 797 aa  696    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  44.68 
 
 		 815 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  45.4 
 
 		 776 aa  673    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  44.53 
 
 		 811 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  46.95 
 
 		 792 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  49.54 
 
 		 805 aa  699    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  45.45 
 
 		 808 aa  638    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  44.9 
 
 		 775 aa  654    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  45.4 
 
 		 776 aa  672    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  45.12 
 
 		 775 aa  675    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  44.97 
 
 		 804 aa  648    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  45.36 
 
 		 804 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  45.29 
 
 		 774 aa  665    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  46.62 
 
 		 812 aa  649    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  46.42 
 
 		 814 aa  660    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  49.22 
 
 		 788 aa  678    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  44.92 
 
 		 813 aa  636    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  44.18 
 
 		 772 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.43 
 
 		 784 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3752  ATP-dependent protease La  48.58 
 
 		 803 aa  667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.728517  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  44.02 
 
 		 817 aa  667    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  43.89 
 
 		 817 aa  662    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  44.59 
 
 		 807 aa  641    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  46.93 
 
 		 880 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  49.61 
 
 		 812 aa  731    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.17 
 
 		 787 aa  646    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  45.14 
 
 		 773 aa  671    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  43.81 
 
 		 778 aa  654    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  47.88 
 
 		 786 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  46.89 
 
 		 810 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  44.11 
 
 		 812 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  44.61 
 
 		 811 aa  643    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  46.39 
 
 		 821 aa  652    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  45.27 
 
 		 776 aa  675    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  44.99 
 
 		 836 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  45.19 
 
 		 806 aa  684    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  45.01 
 
 		 796 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  46.15 
 
 		 823 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  44.25 
 
 		 820 aa  641    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  48.05 
 
 		 797 aa  684    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  42.93 
 
 		 800 aa  636    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  46.03 
 
 		 792 aa  674    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  42.49 
 
 		 807 aa  650    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  45.55 
 
 		 797 aa  676    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  46.94 
 
 		 783 aa  659    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  51.29 
 
 		 835 aa  760    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  44.95 
 
 		 856 aa  660    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  44.02 
 
 		 816 aa  660    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  47.09 
 
 		 789 aa  650    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  45.01 
 
 		 776 aa  670    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.82 
 
 		 784 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>