110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01456 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  51.34 
 
 		 190 aa  181  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  38.97 
 
 		 194 aa  145  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.21 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.4 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.4 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.43 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  31.66 
 
 		 203 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  32.16 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  32.16 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  32.16 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.27 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  25.89 
 
 		 331 aa  86.3  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.18 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  30.57 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  27.14 
 
 		 376 aa  81.6  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.05 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.56 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.56 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.56 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.76 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.06 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.84 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  30.05 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  30.05 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  30.05 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  30.05 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  30.05 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  30.05 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  30.05 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  29.28 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.78 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.32 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  27.32 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  27.32 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  27.32 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  27.32 
 
 		 331 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.21 
 
 		 331 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  27.32 
 
 		 331 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  28.8 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  28.43 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  28.43 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  28.43 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  25.13 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  25.65 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.6 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  26.4 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  30.06 
 
 		 331 aa  72  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.43 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.71 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.75 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  25.15 
 
 		 334 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  26.96 
 
 		 334 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.14 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.41 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  25.76 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  23.93 
 
 		 334 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.34 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.32 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.78 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.15 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  26.6 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  25.77 
 
 		 334 aa  57.8  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.62 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  25.91 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.13 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.58 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.15 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.55 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.53 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  21.99 
 
 		 346 aa  54.7  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.03 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.01 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 		 370 aa  52.4  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  29.28 
 
 		 411 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.59 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.5 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.8 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.99 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.39 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.5 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.78 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  24.03 
 
 		 344 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  21.97 
 
 		 322 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.76 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.13 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  31.21 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.65 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  30.46 
 
 		 417 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.77 
 
 		 375 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.5 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.67 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.76 
 
 		 546 aa  44.7  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.04 
 
 		 357 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.25 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>