More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3986 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3986  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  100 
 
 		 236 aa  477  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.694656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  51.72 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0926  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  49.78 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2803  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  48.47 
 
 		 237 aa  225  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0586673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1407  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  48.03 
 
 		 237 aa  224  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000138709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0710  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  47.03 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  46.19 
 
 		 240 aa  215  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3220  response regulator receiver domain-containing protein  42.55 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.975965  hitchhiker  0.00188513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3263  response regulator  43.23 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0075  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  38.67 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.124346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0058  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  38.67 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000220235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1964  response regulator CheY  30.57 
 
 		 244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 123 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 123 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 		 123 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 123 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.08 
 
 		 310 aa  92.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 125 aa  92.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0040  response regulator  24.78 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000155004  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 124 aa  92  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 231 aa  92  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 124 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  35 
 
 		 123 aa  89.4  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.88 
 
 		 454 aa  89.7  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  35 
 
 		 123 aa  89  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  88.2  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 130 aa  88.2  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  35 
 
 		 123 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 123 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.34 
 
 		 349 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 123 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  40.74 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 123 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  35 
 
 		 123 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 126 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.57 
 
 		 655 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 132 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 126 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 1340 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  35 
 
 		 123 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  39.05 
 
 		 460 aa  85.9  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 1160 aa  85.9  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  35.14 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  36.44 
 
 		 121 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 132 aa  85.1  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.67 
 
 		 858 aa  85.1  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 127 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  36.07 
 
 		 676 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 968 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  35.14 
 
 		 1060 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  31.91 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.79 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 1361 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  43.81 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2089  diguanylate cyclase  38.53 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  34.07 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 870 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.07 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 1177 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  36.36 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 1101 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  35.9 
 
 		 462 aa  82.4  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  32.85 
 
 		 1574 aa  82.8  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  33.06 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 1240 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 1033 aa  82  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 948 aa  82  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  35.59 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1305 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 376 aa  81.6  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 827 aa  81.6  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  32.5 
 
 		 123 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 130 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1352  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 121 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 1158 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 846 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 121 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 770 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 139 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  32.28 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0241  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 123 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 		 1165 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 124 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  34.75 
 
 		 121 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  36.19 
 
 		 125 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>