More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1202 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1202  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  247  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1206  response regulator receiver protein  82.86 
 
 		 145 aa  181  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1248  response regulator receiver protein  47.47 
 
 		 102 aa  105  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1536  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1040 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2331  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000425244  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.05 
 
 		 486 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4419  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 448 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2891  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486665  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 914 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  38.6 
 
 		 513 aa  73.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  35 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  34.45 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0911  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.523432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3740  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  29.27 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 860 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3740  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 454 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0840186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  42.61 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 301 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2175  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 395 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924768  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1607  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1570  transcriptional regulator, XRE family  34.17 
 
 		 233 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  41.74 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0789  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.74 
 
 		 448 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.22 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  41.74 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 476 aa  70.5  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 457 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  41.74 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 934 aa  70.5  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 577 aa  70.5  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  41.74 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 1099 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 829 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  41.74 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  41.74 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  41.74 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 1418 aa  69.3  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0827  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  33.04 
 
 		 460 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  41.74 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3111  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 456 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2371  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 460 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1619  chemotaxis protein CheY  29.57 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 451 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0067  histidine kinase  35.04 
 
 		 486 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2445  response regulator receiver  32.71 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.942791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6875  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0976  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0587  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000905435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 927 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 470 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 709 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3100  response regulator  31.62 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 1016 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2234  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.43 
 
 		 916 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  31.9 
 
 		 882 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  33.33 
 
 		 705 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 242 aa  67.8  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  33.63 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  29.41 
 
 		 312 aa  67.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  34.51 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0674  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0682036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0965  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.73 
 
 		 462 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3857  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  34.23 
 
 		 705 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  30.77 
 
 		 659 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1431 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 233 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3150  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.14204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0872  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 471 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650247 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  33.63 
 
 		 248 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>