More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0587 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0587  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000905435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2881  response regulator receiver protein  61.54 
 
 		 123 aa  160  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000073998  normal  0.0206952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3355  two component Fis family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4152  response regulator receiver protein  58.62 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40 
 
 		 454 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.05 
 
 		 443 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  31.62 
 
 		 1342 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  31.09 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 443 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  37.5 
 
 		 1161 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  33.62 
 
 		 571 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  40.96 
 
 		 513 aa  74.3  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  32.76 
 
 		 571 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  33.05 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 412 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.72 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 503 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.08 
 
 		 229 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 970 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  36.45 
 
 		 705 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  40.96 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  34.26 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.14 
 
 		 589 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4159  nitrogen regulation protein NR(I)  33.87 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.086406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  33.87 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0911  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 456 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 456 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.523432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1120  response regulator  40 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1202  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  33.33 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2330  response regulator receiver domain-containing protein  32.52 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.34 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.34 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.62 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.14 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2461  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.96 
 
 		 581 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 619 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  28.46 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  27.18 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.78 
 
 		 1180 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3722  response regulator receiver  34.17 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30 
 
 		 1956 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  33.33 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1536  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2841  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.37 
 
 		 308 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  36.19 
 
 		 705 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  35.24 
 
 		 1156 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2442  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 292 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0259595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  30 
 
 		 227 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 367 aa  67.4  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0766  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  37.1 
 
 		 477 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 1160 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3242  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 980 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 452 aa  67  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  35.37 
 
 		 248 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.94 
 
 		 225 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 231 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  30.25 
 
 		 1989 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  34.68 
 
 		 470 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  0.0000322182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 452 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  28.21 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0622  two component transcriptional regulator  31.71 
 
 		 240 aa  67  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4390  nitrogen regulation protein NR(I)  33.06 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4272  sigma-54 dependent response regulator  36.52 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  27.5 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.25 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4287  nitrogen regulation protein NR(I)  33.33 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0756679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4333  nitrogen regulation protein NR(I)  33.33 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.2 
 
 		 869 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4505  nitrogen regulation protein NR(I)  33.87 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  25.86 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4253  nitrogen regulation protein NR(I)  33.06 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.177692  normal  0.167125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 1341 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4394  nitrogen regulation protein NR(I)  33.33 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4237  nitrogen regulation protein NR(I)  33.33 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5314  nitrogen regulation protein NR(I)  33.06 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.111299  normal  0.738695 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1206  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4344  nitrogen regulation protein NR(I)  33.06 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4148  nitrogen regulation protein NR(I)  33.06 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>