More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0840 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  100 
 
 		 132 aa  271  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0213  response regulator receiver domain-containing protein  64.75 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  59.84 
 
 		 128 aa  153  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4105  response regulator receiver domain-containing protein  52.63 
 
 		 229 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1519  response regulator receiver protein  53.91 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.043846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1161  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0333  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2120  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  45.3 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  43.1 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 523 aa  97.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4550  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 236 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.9 
 
 		 234 aa  95.5  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  39.2 
 
 		 229 aa  94  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  38.21 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4227  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1722  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 123 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000956357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  39.2 
 
 		 223 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  39.2 
 
 		 223 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  39.2 
 
 		 223 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  39.2 
 
 		 223 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 225 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0623  DNA-binding response regulator  39.2 
 
 		 223 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  39.2 
 
 		 223 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  39.2 
 
 		 223 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4716  DNA-binding response regulator  39.2 
 
 		 223 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 228 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0650  DNA-binding response regulator  38.4 
 
 		 223 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 369 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0711  DNA-binding response regulator  38.4 
 
 		 223 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 236 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 247 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1281  response regulator receiver domain-containing protein  36 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000906166 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  37.6 
 
 		 223 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 229 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  38.58 
 
 		 240 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 230 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.52 
 
 		 227 aa  86.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5611  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 		 235 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.736991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 303 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3042  two-component response regulator  34.92 
 
 		 228 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.330896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.61 
 
 		 316 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  35.83 
 
 		 352 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0544  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 227 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.54 
 
 		 229 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 236 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 223 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  38.21 
 
 		 230 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 227 aa  84.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 234 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.8 
 
 		 231 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.8 
 
 		 231 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  38.05 
 
 		 312 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.94 
 
 		 237 aa  84.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2827  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 230 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  34.68 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 391 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 255 aa  84  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03429  two-component system response regulator (hybrid family) protein  41.13 
 
 		 358 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01810  transcriptional regulatory protein  39.2 
 
 		 226 aa  84  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.35 
 
 		 308 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 		 437 aa  83.6  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  35.54 
 
 		 230 aa  83.6  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 241 aa  83.6  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  35.71 
 
 		 1111 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.13 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.2 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  39.32 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.66 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  37.39 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 437 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0836  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  36.07 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1672  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1192  DNA-binding response regulator  37.01 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00982401  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  36.44 
 
 		 1128 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.57 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  35.51 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.4 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.34 
 
 		 1131 aa  81.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2089  diguanylate cyclase  38.02 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1020  DNA-binding response regulator  37.01 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>