More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2120 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2120  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0213  response regulator receiver domain-containing protein  46.88 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  36.04 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4105  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 229 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374743 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1627  response regulator receiver domain-containing protein  34.43 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.113437 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1638  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.516427  normal  0.805635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1161  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0333  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1519  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.043846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  34.23 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4227  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.43 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  37.1 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 807 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.45 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 237 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3242  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 980 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 		 1002 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 		 1002 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 1942 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.59 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1722  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000956357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1396  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 		 231 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4550  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0347  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 234 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 235 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 247 aa  63.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  32.8 
 
 		 252 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.28 
 
 		 273 aa  63.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0878  DNA-binding response regulator CreB  36.44 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3843  DNA-binding response regulator CreB  36.44 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.980313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.31 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  32.43 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.29 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  36.45 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0614  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0875  DNA-binding response regulator CreB  36.44 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  25.83 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4068  response regulator receiver  37.17 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.71 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 1185 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3042  two-component response regulator  35.45 
 
 		 228 aa  62  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.330896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.55 
 
 		 231 aa  62  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  32.23 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2145  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  30.51 
 
 		 1344 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.04 
 
 		 227 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0174  response regulator receiver  29.17 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 248 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3668  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0492  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 369 aa  61.6  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.82 
 
 		 1131 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0356  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.65 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.23 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 1782 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.4 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0080  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 230 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  32.14 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  34.88 
 
 		 247 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1626  response regulator receiver domain-containing protein  28.45 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2695  response regulator receiver domain-containing protein  30.89 
 
 		 186 aa  60.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00269866  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  34.43 
 
 		 248 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 239 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 239 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>