More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0856 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  249  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  46.72 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  48 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  45.53 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4550  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4105  response regulator receiver domain-containing protein  49.58 
 
 		 229 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  50 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1722  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000956357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0213  response regulator receiver domain-containing protein  47.01 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4227  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1627  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.113437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1519  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.043846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0333  response regulator receiver protein  50 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 231 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 231 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1161  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.19 
 
 		 231 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 138 aa  87  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3140  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0295  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 211 aa  84.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0309  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 211 aa  84.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0962  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.22 
 
 		 377 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115091  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1626  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.17 
 
 		 1131 aa  83.6  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1044  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.22 
 
 		 377 aa  83.6  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0516082 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2179  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0836  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 395 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2156  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 253 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2120  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.93 
 
 		 395 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 390 aa  80.5  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2407  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 		 577 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  38.71 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1070  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 		 575 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.677044  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  41.67 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0347  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  35 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.19 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.5 
 
 		 326 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3975  response regulator receiver domain-containing protein  42.62 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44357  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  37.9 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.31 
 
 		 346 aa  77.8  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 278 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4060  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.97 
 
 		 365 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  42.5 
 
 		 326 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  37.29 
 
 		 1355 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 1341 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  37.9 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.82 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  33.9 
 
 		 961 aa  75.5  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3458  response regulator receiver  44.95 
 
 		 365 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 437 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0965  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 411 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.656429  normal  0.215977 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  38.66 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3535  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283754  normal  0.0368978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  36.29 
 
 		 737 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2827  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  38.02 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0065  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 305 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  42.15 
 
 		 919 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 977 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3723  response regulator receiver  41.12 
 
 		 338 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 364 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  39.02 
 
 		 402 aa  74.7  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.67 
 
 		 308 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 437 aa  74.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4003  response regulator  42.24 
 
 		 357 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 232 aa  73.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 406 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 806 aa  73.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 227 aa  73.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2452  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.95 
 
 		 377 aa  73.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>