More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1722 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1722  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  246  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000956357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1627  response regulator receiver domain-containing protein  56.91 
 
 		 125 aa  150  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.113437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  53.28 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  50.41 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4227  response regulator receiver protein  50 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  48.36 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4550  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0347  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0162  response regulator receiver domain-containing protein  42.62 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0213  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 132 aa  90.1  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3140  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1519  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.043846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4105  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 229 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 231 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 231 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1744  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 229 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0241  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 123 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1626  response regulator receiver domain-containing protein  40.5 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1161  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_137  DNA-binding response regulator  36.29 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 229 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.44 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  36.07 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 277 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2617  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 554 aa  78.2  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  41.18 
 
 		 403 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  36.44 
 
 		 326 aa  77.4  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 223 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 223 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 245 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 223 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  38.21 
 
 		 223 aa  77  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 935 aa  77  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 223 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  38.21 
 
 		 223 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 223 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  35 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  38.66 
 
 		 230 aa  77  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  76.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  33.9 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.25 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  36.13 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.62 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3123  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.13 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  36.07 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  36.97 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  34.17 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.21 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1263  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  37.4 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 397 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  37.5 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 255 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 239 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.79 
 
 		 443 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 227 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 1012 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>