More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0162 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0162  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 127 aa  258  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1722  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000956357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  38.4 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  37.4 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4227  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 130 aa  92  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1627  response regulator receiver domain-containing protein  40.98 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.113437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1626  response regulator receiver domain-containing protein  42.28 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0347  response regulator receiver protein  40.46 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4550  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 		 1158 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 236 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1519  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.043846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 226 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  34.26 
 
 		 286 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.09 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 		 944 aa  62.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 437 aa  62  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.45 
 
 		 488 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1744  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 545 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.73 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  33.93 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1149 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  33.91 
 
 		 685 aa  61.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  39.08 
 
 		 603 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0333  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1155 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 331 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 331 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  27.2 
 
 		 230 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.73 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.27 
 
 		 331 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  27.2 
 
 		 230 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 1185 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 858 aa  60.8  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3967  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 253 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.365316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0213  response regulator receiver domain-containing protein  30.97 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  26.5 
 
 		 228 aa  60.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  27.2 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 870 aa  60.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 232 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 869 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1163 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1398  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.9 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 974 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1155 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1155 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.41 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.36 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1215  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0873  response regulator receiver domain-containing protein  36.25 
 
 		 483 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0633299  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1406  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0894387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0195  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  35.45 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  31.25 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 437 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 440 aa  58.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0930  response regulator receiver protein  36.14 
 
 		 456 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139996  normal  0.100238 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  31.25 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.53 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2347  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.56815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.53 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  26.55 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0922  response regulator receiver protein  35 
 
 		 459 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  28.23 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 687 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 664 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>