More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1519 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1519  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  241  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.043846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  53.91 
 
 		 132 aa  120  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0333  response regulator receiver protein  60.98 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  50 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  43.9 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  43.9 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  44.26 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4105  response regulator receiver domain-containing protein  48.72 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0213  response regulator receiver domain-containing protein  46.15 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1627  response regulator receiver domain-containing protein  37.9 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.113437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4227  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 130 aa  94  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1626  response regulator receiver domain-containing protein  44.26 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3140  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1722  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000956357 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1161  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4550  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2120  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 243 aa  77.4  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  42.59 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  41.32 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 229 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.28 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 230 aa  72  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  45.28 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  36.28 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 243 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  40.19 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0549  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 523 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 239 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 231 aa  70.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0347  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 229 aa  70.1  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 228 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 251 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4132  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.04 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2032  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.94 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4204  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.04 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0289  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1370  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1281  response regulator receiver domain-containing protein  32.8 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000906166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 957 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  39.09 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  36.36 
 
 		 705 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  34.23 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  39.09 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  39.09 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.93 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.9 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  32.8 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0847  two component diguanylate cyclase  34.96 
 
 		 327 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4336  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.11 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  33.33 
 
 		 356 aa  68.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3702  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.19 
 
 		 863 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3596  two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  35.29 
 
 		 356 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  39.45 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  38.18 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  39.45 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  35.78 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0001  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000051182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03429  two-component system response regulator (hybrid family) protein  40.19 
 
 		 358 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0614  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  32.26 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  31.45 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  35.14 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 309 aa  68.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>