More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0001 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0001  response regulator receiver protein  100 
 
 		 118 aa  236  5.999999999999999e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000051182 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 225 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 234 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 234 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  35.19 
 
 		 705 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 237 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  35.65 
 
 		 240 aa  84  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1713  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.29 
 
 		 237 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0484795  normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1534  phosphate regulon two-component response regulator transcription regulator protein  38.39 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  34.26 
 
 		 705 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  32.76 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  39.09 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  39.09 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  32.76 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  37.5 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  31.3 
 
 		 229 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 523 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.32 
 
 		 225 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 229 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0622  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 240 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 236 aa  80.1  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.48 
 
 		 227 aa  80.1  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.21 
 
 		 226 aa  80.1  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  39.09 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  39.09 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  31.36 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0785  DNA-binding response regulator PhoB  38.39 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1623  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.39 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0579  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.39 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0503015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1520  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.39 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1490  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.39 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0572  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.39 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2768  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.39 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.368066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.7 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  32.76 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1296  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.39 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  37.27 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  34.82 
 
 		 290 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.36 
 
 		 443 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  36.36 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.36 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 354 aa  77.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 275 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0887  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  0.0397846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1271  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624894  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2853  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 233 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 224 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 216 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1194  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 233 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.484581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4448  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 233 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1276  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 233 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2015  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 233 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  37.27 
 
 		 234 aa  77.4  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0824  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 233 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 226 aa  77  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1182  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 233 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1305  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 233 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920206  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32.76 
 
 		 236 aa  77  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  29.31 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  38.32 
 
 		 226 aa  76.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 233 aa  77  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  34.29 
 
 		 225 aa  77  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 229 aa  77  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.66 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>