More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0213 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0213  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  252  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  62.6 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  64.75 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4105  response regulator receiver domain-containing protein  53.45 
 
 		 229 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2120  response regulator receiver protein  46.88 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  46.09 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  46.96 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0333  response regulator receiver protein  51.3 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1519  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.043846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4550  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 127 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1722  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000956357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1161  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 523 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4227  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 130 aa  90.1  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 236 aa  90.1  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 245 aa  88.2  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 245 aa  87  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 242 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  44.17 
 
 		 242 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 225 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  42.37 
 
 		 242 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  38.71 
 
 		 229 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1672  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 229 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 336 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1832  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.372268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1806  alkaline phosphatase synthesis response regulator  41.38 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000153503  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1975  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0483655  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2010  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.93984e-43 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  43.86 
 
 		 714 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  38.98 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.83 
 
 		 1131 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  41.53 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1789  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.52 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11323  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1627  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.113437 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  39.47 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  42.61 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 229 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0203  response regulator receiver  39.32 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 232 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2059  DNA-binding response regulator  40.52 
 
 		 229 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000985599  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  39.5 
 
 		 312 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2179  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  38.4 
 
 		 348 aa  80.1  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.98 
 
 		 229 aa  80.5  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  37.82 
 
 		 170 aa  80.1  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  39.02 
 
 		 242 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 589 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  44.35 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  38.26 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 437 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  43.1 
 
 		 290 aa  78.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 806 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2855  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 348 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3140  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3668  response regulator receiver protein  58.73 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.87 
 
 		 314 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 434 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 231 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 437 aa  78.2  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 434 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 239 aa  77.8  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 232 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4221  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 240 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.430301  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 356 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 231 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 823 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>