More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3993 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  49.19 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  47.58 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  46.77 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4227  response regulator receiver protein  46.77 
 
 		 130 aa  120  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482069  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 123 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 123 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1722  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000956357 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1627  response regulator receiver domain-containing protein  39.34 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.113437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4550  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0347  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 245 aa  96.7  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 245 aa  94.4  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3140  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 235 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4105  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 		 229 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 242 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 229 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  38.66 
 
 		 242 aa  91.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.34 
 
 		 354 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 443 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.13 
 
 		 443 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  38.66 
 
 		 242 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.7 
 
 		 244 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0333  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 225 aa  87.8  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  41.82 
 
 		 233 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 231 aa  87.8  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.21 
 
 		 229 aa  87.8  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  40.68 
 
 		 403 aa  87  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0213  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.59 
 
 		 226 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.44 
 
 		 231 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  35.54 
 
 		 247 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 275 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 225 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 231 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 234 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 236 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.6 
 
 		 1131 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  40.98 
 
 		 352 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 229 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 235 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  37.17 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 212 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 229 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  37.17 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1519  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.043846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 247 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.13 
 
 		 236 aa  84.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  36.44 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.13 
 
 		 239 aa  84  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 687 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  42.24 
 
 		 355 aa  84  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 248 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 240 aa  83.6  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 231 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 231 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  36.97 
 
 		 242 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  34.96 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  36.13 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.7 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 1406 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  36.44 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 443 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 870 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  34.15 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.47 
 
 		 385 aa  82  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0241  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  33.06 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1626  response regulator receiver domain-containing protein  35.48 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0544  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>