More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3504 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4227  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 130 aa  150  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  56.45 
 
 		 132 aa  149  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  55.74 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  55.65 
 
 		 124 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  47.58 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4550  response regulator receiver protein  52.42 
 
 		 127 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1722  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000956357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3140  response regulator receiver protein  51.22 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  48 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1519  response regulator receiver protein  50 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.043846  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0213  response regulator receiver domain-containing protein  52.17 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1627  response regulator receiver domain-containing protein  41.8 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.113437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4105  response regulator receiver domain-containing protein  53.51 
 
 		 229 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  51.3 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0333  response regulator receiver protein  49.6 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 123 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 123 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0347  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.44 
 
 		 1131 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1626  response regulator receiver domain-containing protein  39.52 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  42.11 
 
 		 352 aa  95.5  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 225 aa  93.6  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  45.61 
 
 		 462 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2120  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1161  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 235 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 225 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 236 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 163 aa  90.5  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  45.61 
 
 		 414 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  44.04 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 216 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 216 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 242 aa  88.6  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.73 
 
 		 229 aa  87.8  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.88 
 
 		 326 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.35 
 
 		 454 aa  87.8  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  43.81 
 
 		 247 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 234 aa  87.4  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.4 
 
 		 246 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  36.43 
 
 		 231 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.9 
 
 		 239 aa  87.4  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 223 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 204 aa  87  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  39.34 
 
 		 236 aa  87  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 223 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  36.89 
 
 		 223 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  36.89 
 
 		 223 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 247 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 223 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 223 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 230 aa  87  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 223 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.84 
 
 		 354 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  45.22 
 
 		 457 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 229 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 365 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 223 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 223 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 247 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.44 
 
 		 331 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 229 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 225 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  45.71 
 
 		 239 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.57 
 
 		 352 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  41.8 
 
 		 229 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  43.44 
 
 		 248 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 246 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.36 
 
 		 434 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.36 
 
 		 434 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 248 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  42.34 
 
 		 355 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  44.76 
 
 		 216 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  39.45 
 
 		 231 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.68 
 
 		 367 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  48.28 
 
 		 454 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.71 
 
 		 240 aa  84.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  43.59 
 
 		 246 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 231 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.53 
 
 		 509 aa  84.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.45 
 
 		 246 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4068  response regulator receiver  43.59 
 
 		 377 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706307  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.45 
 
 		 246 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 243 aa  84.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 236 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  47.67 
 
 		 457 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 223 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  42.62 
 
 		 248 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>