More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2946 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  55.74 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  53.66 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4227  response regulator receiver protein  52.03 
 
 		 130 aa  143  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  56.56 
 
 		 124 aa  140  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1722  response regulator receiver protein  50.41 
 
 		 123 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000956357 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4550  response regulator receiver protein  51.64 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1627  response regulator receiver domain-containing protein  47.97 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.113437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1519  response regulator receiver protein  43.9 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.043846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1626  response regulator receiver domain-containing protein  44.63 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0213  response regulator receiver domain-containing protein  45.76 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4105  response regulator receiver domain-containing protein  45.3 
 
 		 229 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374743 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0347  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0162  response regulator receiver domain-containing protein  43.44 
 
 		 127 aa  95.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0333  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3140  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 128 aa  90.5  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.98 
 
 		 385 aa  90.1  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1161  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  42.86 
 
 		 352 aa  88.6  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 229 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 236 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2355  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 227 aa  84.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  40.68 
 
 		 241 aa  84  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 229 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 163 aa  84  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  36.89 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4003  response regulator  40.68 
 
 		 357 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  39.32 
 
 		 1347 aa  82  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.84 
 
 		 454 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  42.37 
 
 		 458 aa  80.9  0.000000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  38.14 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.21 
 
 		 229 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 236 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.57 
 
 		 350 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 1010 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 231 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  37.29 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 234 aa  80.5  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.68 
 
 		 352 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 225 aa  80.5  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  35.83 
 
 		 230 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 230 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  42.37 
 
 		 458 aa  79.7  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  40.68 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  32.26 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 383 aa  79.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.62 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  38.89 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2382  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 		 359 aa  78.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 365 aa  78.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  36.13 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  36 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  39.5 
 
 		 561 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 355 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.9 
 
 		 1131 aa  78.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  35 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 275 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 1341 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 227 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.79 
 
 		 367 aa  77.8  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 235 aa  77.8  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2179  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 234 aa  77.8  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 228 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 232 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  44.17 
 
 		 303 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.9 
 
 		 326 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>