More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0332 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  68.38 
 
 		 767 aa  951    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  100 
 
 		 806 aa  1579    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3032  glycosyl transferase family 2  56.87 
 
 		 627 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0015  glycosyl transferase family protein  47.39 
 
 		 684 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  36 
 
 		 483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.03 
 
 		 241 aa  114  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 236 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 240 aa  110  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 326 aa  109  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.64 
 
 		 941 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.34 
 
 		 318 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.28 
 
 		 228 aa  108  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.3 
 
 		 371 aa  107  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  33.59 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 		 471 aa  106  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 227 aa  105  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 229 aa  105  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  39.22 
 
 		 229 aa  105  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.41 
 
 		 229 aa  105  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36 
 
 		 1131 aa  104  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.65 
 
 		 212 aa  104  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 272 aa  104  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.04 
 
 		 340 aa  103  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.483  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 232 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 231 aa  103  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  47.58 
 
 		 247 aa  103  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.75 
 
 		 310 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 232 aa  103  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 223 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.35 
 
 		 236 aa  102  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.59 
 
 		 237 aa  103  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  48.39 
 
 		 239 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.44 
 
 		 239 aa  103  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  48.39 
 
 		 239 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 390 aa  103  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  48.39 
 
 		 239 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 234 aa  103  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 227 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1275  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.19 
 
 		 304 aa  102  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00827298  normal  0.435617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.97 
 
 		 247 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.72 
 
 		 239 aa  102  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 238 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.26 
 
 		 235 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  45.95 
 
 		 223 aa  101  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  45.95 
 
 		 223 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  45.95 
 
 		 223 aa  101  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  45.95 
 
 		 223 aa  101  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 243 aa  101  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 1341 aa  101  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  45.95 
 
 		 223 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 215 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  52.14 
 
 		 234 aa  101  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  48.36 
 
 		 236 aa  101  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 259 aa  101  7e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 239 aa  101  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 239 aa  101  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  100  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  42.97 
 
 		 239 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  40.26 
 
 		 216 aa  100  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 225 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.9 
 
 		 1390 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 231 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 230 aa  100  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 234 aa  100  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.86 
 
 		 239 aa  100  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 243 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 225 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 243 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.9 
 
 		 1390 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.09 
 
 		 313 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 243 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.9 
 
 		 1390 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 221 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 		 243 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.79 
 
 		 231 aa  99.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  45.05 
 
 		 223 aa  99.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  45.05 
 
 		 223 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 443 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 231 aa  99.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 229 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  45.05 
 
 		 223 aa  99.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  40.14 
 
 		 248 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 236 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 		 229 aa  100  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  45.05 
 
 		 223 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 125 aa  99.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1230  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 254 aa  99  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 		 217 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 243 aa  99  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.85 
 
 		 242 aa  99  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  41.03 
 
 		 170 aa  99.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 230 aa  99  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  38.71 
 
 		 248 aa  99  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  42.74 
 
 		 254 aa  98.6  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 226 aa  98.6  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 234 aa  98.6  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.01 
 
 		 235 aa  98.6  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  46.15 
 
 		 236 aa  98.2  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  47.11 
 
 		 234 aa  98.2  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 234 aa  97.8  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>