More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0295 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0295  response regulator receiver protein  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0309  response regulator receiver protein  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1937  response regulator receiver protein  65.2 
 
 		 209 aa  292  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2156  response regulator receiver protein  63.9 
 
 		 212 aa  284  5.999999999999999e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1618  response regulator receiver domain-containing protein  60.29 
 
 		 208 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2365  response regulator receiver protein  54.37 
 
 		 221 aa  238  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.878823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1936  response regulator receiver protein  42.44 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.941096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0965  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 411 aa  156  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.656429  normal  0.215977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1478  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 426 aa  156  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2157  response regulator receiver protein  43.38 
 
 		 140 aa  129  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1472  response regulator receiver domain-containing protein  39.76 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1613  response regulator receiver domain-containing protein  39.16 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2638  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1120  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 121 aa  95.9  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  48.57 
 
 		 278 aa  95.9  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 367 aa  94.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.26 
 
 		 488 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 566 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1290  response regulator receiver domain-containing protein  31.54 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0398519  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 383 aa  85.9  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  43.69 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 		 896 aa  85.1  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1792 aa  85.1  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  38.46 
 
 		 123 aa  84.7  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 		 1322 aa  84.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2024  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 136 aa  84.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 126 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 125 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 933 aa  82.8  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 1629 aa  82.4  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 553 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 2099 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 858 aa  82.4  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  34.84 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  36.75 
 
 		 705 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 		 367 aa  81.6  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 376 aa  81.6  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  35.9 
 
 		 705 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  34.39 
 
 		 246 aa  81.3  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  38.33 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 236 aa  81.3  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  34.39 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1886  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.41 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3458  response regulator receiver  43.69 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  42.86 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1992  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  40.68 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50640  response regulator with metal dependent phosphohydrolase activity (two-component)  44.34 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.21 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2347  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.56815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  43.27 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 541 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  37.1 
 
 		 125 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.4 
 
 		 1131 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.59 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 823 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1857 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  41.23 
 
 		 896 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  41.23 
 
 		 896 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  41.23 
 
 		 896 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.97 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 2099 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0512  response regulator PleD  32.75 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.2 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  41.23 
 
 		 896 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2464  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.01 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4068  response regulator receiver  40.95 
 
 		 377 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  37.19 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6875  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  41.23 
 
 		 896 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 541 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  35.15 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  40.35 
 
 		 896 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 531 aa  79  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>