More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1638 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1638  response regulator receiver protein  100 
 
 		 164 aa  340  5.999999999999999e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.516427  normal  0.805635 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0492  sensor histidine kinase/response regulator  38.98 
 
 		 369 aa  87  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2120  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 131 aa  84  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.32 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  36.7 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.68 
 
 		 1053 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  39.82 
 
 		 513 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  39.81 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  32.04 
 
 		 734 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 782 aa  75.1  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 237 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.62 
 
 		 317 aa  74.3  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  36.79 
 
 		 229 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09498  two-component system, transcriptional regulatory protein  34.48 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.38 
 
 		 655 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  39.13 
 
 		 1023 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.39 
 
 		 858 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.9 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.04 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0213  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5056  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.86 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0472  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 		 517 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 226 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.74 
 
 		 326 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3934  DNA-binding response regulator  36.31 
 
 		 223 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  29.2 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.85 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0280  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 295 aa  72  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.932912 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  31.37 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 		 124 aa  72  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 916 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 523 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  32.74 
 
 		 326 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.09 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6685  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  31.54 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4970  two component transcriptional regulator  34.58 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.71 
 
 		 589 aa  71.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 685 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.54 
 
 		 241 aa  70.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 873 aa  70.5  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  35.04 
 
 		 457 aa  70.5  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  33.87 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  33.87 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4249  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.04 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.316157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  27.43 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  33.87 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  27.43 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0183  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32.41 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00404304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.76 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0173  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32.41 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.505642  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 1260 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0347  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  31.62 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  34.62 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  33.63 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.52 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  34.19 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  34.19 
 
 		 457 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  34.26 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1240 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  27.81 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.63 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  31.78 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1177 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  34.19 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  36.45 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  35.51 
 
 		 1028 aa  68.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  36.11 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.19 
 
 		 464 aa  68.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1242  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  31.21 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>