More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1396 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1396  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 232 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.53 
 
 		 216 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.53 
 
 		 216 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 233 aa  97.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 231 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.13 
 
 		 371 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.84 
 
 		 212 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 231 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 226 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 225 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 225 aa  94  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 231 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 229 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 231 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 231 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 231 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 215 aa  91.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 229 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 376 aa  90.1  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 225 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  38.21 
 
 		 229 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 236 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 305 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 236 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 234 aa  88.6  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 239 aa  88.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.59 
 
 		 238 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 713 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0289  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 232 aa  88.2  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 231 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3574  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 301 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0249095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 735 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 242 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  38.52 
 
 		 718 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  34.45 
 
 		 242 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 305 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 714 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 234 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  37.96 
 
 		 312 aa  87  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 		 221 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 229 aa  87  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  41.88 
 
 		 1355 aa  87  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.53 
 
 		 337 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4451  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.48 
 
 		 314 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.5 
 
 		 231 aa  86.7  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 234 aa  86.3  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 474 aa  86.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  36.67 
 
 		 242 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3383  response regulator receiver  37.04 
 
 		 300 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 240 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3692  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 300 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  35.83 
 
 		 265 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  45.37 
 
 		 1374 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0804  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.68 
 
 		 314 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.504991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  38.46 
 
 		 1378 aa  84.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 229 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 370 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 333 aa  84.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  37.8 
 
 		 233 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 230 aa  84.3  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  35.29 
 
 		 242 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 235 aa  84.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  84.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  84.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  35.2 
 
 		 229 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 241 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 242 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  33.33 
 
 		 229 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.83 
 
 		 236 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  36.67 
 
 		 242 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  33.06 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.84 
 
 		 488 aa  84  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 309 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 236 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3452  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 229 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00686704  hitchhiker  0.000158375 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.77 
 
 		 236 aa  83.6  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 313 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.17 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.17 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  31.2 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.83 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.26 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>