More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1192 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1192  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00982401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1020  DNA-binding response regulator  98.69 
 
 		 229 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0358  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 229 aa  221  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0682  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2295  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.8 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  44.49 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  44.05 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  44.05 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  43.17 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  43.61 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  40.62 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  44.2 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 237 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.69 
 
 		 245 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 242 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 232 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 242 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  41.23 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 230 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 231 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 232 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 251 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 233 aa  171  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  40.79 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 238 aa  169  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  40.26 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  40.27 
 
 		 233 aa  168  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  40.89 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0119  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  38.67 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  38.57 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  38.5 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>