More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0009 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  65.88 
 
 		 516 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.53 
 
 		 511 aa  684    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.14 
 
 		 509 aa  677    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 508 aa  1033    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  60.67 
 
 		 508 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0871  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 726 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 711 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 677 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 719 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 503 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 880 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 531 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 884 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 911 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 498 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 1691 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 637 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 905 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 958 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.39 
 
 		 1287 aa  170  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 1017 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 546 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 1042 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 803 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 		 680 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 3470 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 885 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.97 
 
 		 1131 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 505 aa  159  8e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 499 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 701 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 612 aa  158  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 1014 aa  157  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 899 aa  157  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 1039 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.7 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  35.8 
 
 		 461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 534 aa  153  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  35.8 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  28.54 
 
 		 581 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 		 561 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 695 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  28.27 
 
 		 617 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  35.41 
 
 		 461 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 556 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 371 aa  151  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 718 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 556 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0979  two component sensor histidine kinase  27.89 
 
 		 550 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.325763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 899 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 893 aa  150  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  26.93 
 
 		 729 aa  150  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 458 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 722 aa  149  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 		 933 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 633 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 1211 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  34.29 
 
 		 1111 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  27.29 
 
 		 581 aa  147  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.84 
 
 		 667 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 1291 aa  146  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 1046 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 763 aa  146  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 593 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  32.81 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 581 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 		 555 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 631 aa  145  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 		 1064 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 2161 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3930  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0182336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 2153 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 620 aa  144  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 571 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 		 679 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 593 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 588 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 687 aa  143  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  24.64 
 
 		 484 aa  143  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 639 aa  143  8e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 577 aa  143  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 546 aa  143  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  25.71 
 
 		 762 aa  143  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1174 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.05 
 
 		 944 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 680 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 		 704 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 593 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 621 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 674 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 916 aa  141  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  28.5 
 
 		 595 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>