More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0604 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1174 aa  2369    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
1211 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
1014 aa  300  7e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
1017 aa  294  7e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
711 aa  233  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
719 aa  226  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
726 aa  204  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
677 aa  201  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 
944 aa  174  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5362  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
643 aa  162  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 
815 aa  158  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
612 aa  155  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 
958 aa  152  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
827 aa  152  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0979  two component sensor histidine kinase  30.45 
 
 
550 aa  152  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.325763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
612 aa  151  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
641 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
399 aa  150  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
392 aa  149  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
639 aa  148  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
639 aa  148  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
546 aa  148  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3340  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
557 aa  147  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
1319 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
509 aa  147  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
511 aa  147  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 
880 aa  146  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
639 aa  145  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
640 aa  145  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
725 aa  144  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
625 aa  143  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
726 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.62189  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  27 
 
 
1021 aa  142  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
508 aa  142  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  33.55 
 
 
1046 aa  142  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
722 aa  142  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
556 aa  141  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
556 aa  141  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
620 aa  140  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
933 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
508 aa  140  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  28.88 
 
 
1111 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  33.84 
 
 
617 aa  139  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  30.28 
 
 
1629 aa  138  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  36.51 
 
 
919 aa  138  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  29.06 
 
 
762 aa  137  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
592 aa  137  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
1002 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
463 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
646 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
758 aa  136  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
885 aa  135  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
601 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
695 aa  135  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 
905 aa  135  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
601 aa  135  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  32.72 
 
 
729 aa  135  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5063  adaptive-response sensory kinase  31.55 
 
 
393 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158063 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 
657 aa  134  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
1060 aa  134  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  27.46 
 
 
689 aa  134  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
1026 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
718 aa  134  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
763 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1303  adaptive-response sensory kinase  34 
 
 
391 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
377 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
488 aa  134  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
470 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17681  two-component sensor histidine kinase  27.2 
 
 
689 aa  134  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.335797  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1331  adaptive-response sensory kinase  34 
 
 
391 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
584 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
546 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  32.42 
 
 
576 aa  132  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
584 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  34.92 
 
 
560 aa  132  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
718 aa  131  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
701 aa  131  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2558  histidine kinase  34.66 
 
 
397 aa  131  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
901 aa  131  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
754 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
916 aa  130  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1130  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
748 aa  130  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0908  histidine kinase  34.33 
 
 
388 aa  130  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  33.74 
 
 
508 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
571 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
755 aa  129  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
609 aa  129  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3109  sensor protein  33.06 
 
 
485 aa  129  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
1203 aa  128  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
687 aa  128  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  23.26 
 
 
465 aa  128  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
679 aa  128  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.43 
 
 
1407 aa  127  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 
911 aa  127  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
1352 aa  127  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0538  histidine kinase  33.2 
 
 
550 aa  127  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5388  histidine kinase  29.54 
 
 
651 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
614 aa  127  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 
581 aa  127  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>