More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1619 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
899 aa  1800    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  86.1 
 
 
899 aa  1569    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0484  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
901 aa  469  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0770667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
893 aa  449  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 
752 aa  275  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
885 aa  234  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
3470 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
2153 aa  223  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
2161 aa  220  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
880 aa  210  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
2783 aa  203  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
612 aa  201  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
905 aa  198  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
911 aa  189  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
677 aa  188  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
458 aa  187  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 
944 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
546 aa  184  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
577 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
556 aa  182  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
884 aa  180  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
556 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
581 aa  178  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
718 aa  177  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
608 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
608 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
489 aa  175  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
701 aa  174  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 
815 aa  174  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  26.79 
 
 
586 aa  173  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
596 aa  173  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
1319 aa  174  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
1042 aa  172  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
958 aa  171  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
722 aa  171  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
612 aa  170  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
599 aa  170  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
444 aa  170  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
1002 aa  165  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
711 aa  165  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1776  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 
710 aa  164  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.548217  normal  0.563692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
492 aa  164  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0351302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
695 aa  163  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
566 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
511 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  31.52 
 
 
537 aa  162  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
1039 aa  162  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
592 aa  162  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  29.79 
 
 
589 aa  161  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
596 aa  161  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
401 aa  161  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
571 aa  161  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
584 aa  161  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
584 aa  160  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 
718 aa  159  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 
508 aa  158  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
460 aa  157  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  31.73 
 
 
762 aa  157  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
594 aa  157  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
725 aa  156  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
595 aa  157  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
1010 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
590 aa  156  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
508 aa  157  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  29.97 
 
 
581 aa  155  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
456 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
719 aa  156  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
581 aa  156  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
509 aa  155  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
418 aa  155  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2661  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
602 aa  155  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  30.86 
 
 
346 aa  155  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
468 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
646 aa  154  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
371 aa  154  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
587 aa  154  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
604 aa  153  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
625 aa  153  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
608 aa  153  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
610 aa  153  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
577 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
637 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
590 aa  152  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  26.91 
 
 
575 aa  152  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
613 aa  151  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 
614 aa  151  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.07 
 
 
1021 aa  151  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  35.65 
 
 
461 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  35.65 
 
 
461 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 
600 aa  150  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  34.93 
 
 
461 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
590 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
608 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3846  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
352 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  29.19 
 
 
581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  29.2 
 
 
867 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
556 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
611 aa  149  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 
555 aa  149  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
758 aa  149  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>