More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2551 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 401 aa  795    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 		 489 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 		 581 aa  255  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 453 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 592 aa  249  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 		 584 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 587 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 594 aa  246  6.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 584 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 589 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 460 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 		 458 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 589 aa  233  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2661  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 602 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  39.64 
 
 		 346 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 607 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  41.74 
 
 		 591 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  34.03 
 
 		 598 aa  226  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  40.97 
 
 		 537 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 591 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 582 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 608 aa  223  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 554 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  35.9 
 
 		 554 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  39.88 
 
 		 575 aa  219  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 456 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  38.86 
 
 		 584 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  38.97 
 
 		 587 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  38.97 
 
 		 587 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 585 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  35.16 
 
 		 565 aa  216  5e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 418 aa  215  9e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 587 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 611 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  38.11 
 
 		 587 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  38.11 
 
 		 587 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  38.11 
 
 		 587 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  38.11 
 
 		 587 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  37.21 
 
 		 613 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  38.11 
 
 		 587 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 596 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  38.11 
 
 		 587 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  37.82 
 
 		 587 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 600 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  37.64 
 
 		 581 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 624 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 608 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2891  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 615 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.031526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 619 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  43.81 
 
 		 376 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  34.83 
 
 		 613 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  34.83 
 
 		 613 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.49 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0468  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 596 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  34.56 
 
 		 613 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  34.56 
 
 		 613 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  34.56 
 
 		 613 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  34.56 
 
 		 613 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 606 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  34.56 
 
 		 613 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 468 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  34.3 
 
 		 613 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 585 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  34.59 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 581 aa  206  6e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 612 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  35.98 
 
 		 599 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  37.36 
 
 		 581 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 609 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 608 aa  203  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 346 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 585 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 602 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 599 aa  202  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 678 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  36.69 
 
 		 571 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0706  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 611 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 590 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 590 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 571 aa  201  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  36.13 
 
 		 571 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 593 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 621 aa  195  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 350 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 595 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 422 aa  189  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  37.71 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  33.17 
 
 		 434 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 621 aa  188  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 346 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 597 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  37.96 
 
 		 346 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  34 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  39.81 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>