More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2950 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  68.7 
 
 
678 aa  822    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.41 
 
 
606 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
602 aa  1215    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2891  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
615 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.031526 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2661  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
602 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0706  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
611 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174577  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0468  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
596 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
589 aa  301  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
584 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
592 aa  282  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  37.86 
 
 
537 aa  281  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 
584 aa  276  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
590 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
587 aa  262  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
599 aa  259  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
585 aa  253  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  33.28 
 
 
591 aa  253  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  30.6 
 
 
599 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  30.27 
 
 
581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
608 aa  243  7.999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
597 aa  236  9e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
590 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  29.53 
 
 
581 aa  234  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
608 aa  234  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
595 aa  233  6e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
589 aa  229  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
581 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
594 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
585 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
624 aa  223  8e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
585 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
612 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
460 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  32.21 
 
 
587 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  31.21 
 
 
587 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  32.21 
 
 
587 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
587 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
582 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 
593 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  31.77 
 
 
587 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  31.77 
 
 
587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  31.77 
 
 
587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  31.94 
 
 
587 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  31.77 
 
 
587 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  31.72 
 
 
587 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 
591 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
571 aa  208  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
608 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
453 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  29.16 
 
 
571 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  31.34 
 
 
575 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  28.96 
 
 
571 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
412 aa  201  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  26.52 
 
 
608 aa  200  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
608 aa  200  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0568  histidine kinase  43.92 
 
 
669 aa  200  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
401 aa  199  9e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
412 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  27.66 
 
 
598 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
458 aa  197  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  30.79 
 
 
584 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
600 aa  194  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  25.95 
 
 
610 aa  194  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
609 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
489 aa  194  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
456 aa  194  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 
619 aa  194  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
590 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
607 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
444 aa  192  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
621 aa  192  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  27.13 
 
 
565 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
621 aa  187  5e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  30.77 
 
 
762 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
556 aa  183  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  25 
 
 
613 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
571 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  31.43 
 
 
346 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
623 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  27.93 
 
 
554 aa  181  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
597 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
554 aa  181  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
571 aa  180  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
591 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
597 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2921  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
589 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
604 aa  175  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
758 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
591 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
418 aa  173  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
584 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
429 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
587 aa  170  8e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
612 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  25.16 
 
 
613 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  25.28 
 
 
613 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  25.28 
 
 
613 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>