More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4049 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
468 aa  944    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
489 aa  316  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 
458 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  44.48 
 
 
346 aa  269  8.999999999999999e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 
444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
456 aa  254  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
585 aa  253  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  37.39 
 
 
591 aa  252  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
581 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
594 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  35.19 
 
 
587 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  36.72 
 
 
587 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  36.72 
 
 
587 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
587 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  36.97 
 
 
587 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  36.72 
 
 
587 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 
418 aa  242  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  36.72 
 
 
587 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  36.72 
 
 
587 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  36.72 
 
 
587 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  36.72 
 
 
587 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
589 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
590 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
611 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  36.56 
 
 
598 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
600 aa  234  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
612 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  37.06 
 
 
613 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
582 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  38.07 
 
 
565 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 
590 aa  230  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
607 aa  231  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
608 aa  229  8e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  39.07 
 
 
571 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
619 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  37.26 
 
 
613 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
571 aa  226  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  37.26 
 
 
613 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  38.8 
 
 
571 aa  226  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
596 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  36.99 
 
 
613 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  36.53 
 
 
613 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  36.99 
 
 
613 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  36.99 
 
 
613 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  36.53 
 
 
613 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  36.99 
 
 
613 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
599 aa  223  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
584 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  40.11 
 
 
537 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
591 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
585 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  41.59 
 
 
575 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
587 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
592 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
608 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
589 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  34.53 
 
 
584 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
460 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
597 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  36.32 
 
 
554 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
554 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
608 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  34.55 
 
 
581 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
597 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
621 aa  212  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
584 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
609 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3813  sensor histidine kinase ResE  34.13 
 
 
591 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000821443  hitchhiker  2.81471e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1532  sensor histidine kinase ResE  34.13 
 
 
591 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0525759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1638  sensor histidine kinase ResE  34.13 
 
 
591 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1602  sensor histidine kinase ResE  34.13 
 
 
591 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1387  sensor histidine kinase ResE  34.13 
 
 
591 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1359  sensor histidine kinase  34.13 
 
 
591 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.805336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1498  sensor histidine kinase ResE  34.13 
 
 
591 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000125371  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1360  sensor histidine kinase  34.13 
 
 
591 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000268966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1570  sensor histidine kinase ResE  34.13 
 
 
591 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4159100000000003e-40 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
597 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  32.85 
 
 
599 aa  207  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
591 aa  206  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
590 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 
571 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
429 aa  204  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
412 aa  203  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
593 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
621 aa  203  5e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  36.51 
 
 
581 aa  203  7e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
581 aa  202  9e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
423 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
401 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
623 aa  202  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
591 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
585 aa  199  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
608 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  31.57 
 
 
608 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  32.79 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2891  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.031526 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0720  sensory box histidine kinase  34.21 
 
 
449 aa  197  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>