More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1559 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  99.71 
 
 		 346 aa  684    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 346 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  90.41 
 
 		 346 aa  620  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.06 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1263  histidine kinase  55.13 
 
 		 346 aa  334  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  52.23 
 
 		 346 aa  325  6e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1532  histidine kinase  52.74 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.628543  normal  0.374808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 		 445 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  47.08 
 
 		 438 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  46.63 
 
 		 451 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  45.48 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  41.81 
 
 		 407 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.94 
 
 		 423 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0167  histidine kinase  41.81 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114642  normal  0.326562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  46.97 
 
 		 417 aa  259  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.06 
 
 		 422 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 		 449 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  45.09 
 
 		 363 aa  255  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  44.82 
 
 		 478 aa  255  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  45.22 
 
 		 450 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  45.22 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  47.04 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 		 415 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  49.01 
 
 		 443 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0312  putative sensor histidine kinase  43.35 
 
 		 438 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0298  sensor histidine kinase, putative  43.35 
 
 		 438 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  44.35 
 
 		 510 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0478  histidine kinase  42.82 
 
 		 438 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  42.86 
 
 		 419 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2916  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.48 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.301233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2689  histidine kinase  44.48 
 
 		 430 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  42.12 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  40.66 
 
 		 424 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4551  histidine kinase  40.21 
 
 		 480 aa  218  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2689  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10288  normal  0.570693 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1535  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.2 
 
 		 459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.896315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3575  histidine kinase  42.81 
 
 		 416 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455968  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 489 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 482 aa  208  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 456 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 449 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  39.05 
 
 		 446 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1287  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 468 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 584 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 		 584 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2275  histidine kinase  40.87 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0585084  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  42.38 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 585 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 454 aa  193  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.434659  normal  0.0783763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 440 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 464 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 376 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 468 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 476 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2400  Signal transduction histidine kinase, PhoR  36.94 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.595791  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.76 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2258  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 451 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.42492 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1492  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 465 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  40.72 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 581 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 465 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  33.43 
 
 		 587 aa  186  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 589 aa  186  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 458 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  33.43 
 
 		 587 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  33.43 
 
 		 587 aa  185  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 418 aa  185  9e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 448 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2661  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 602 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 612 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 587 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  33.14 
 
 		 587 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  33.14 
 
 		 587 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  33.81 
 
 		 587 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  33.14 
 
 		 587 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  40.75 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  33.14 
 
 		 587 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3104  histidine protein kinase PhoR  38.76 
 
 		 438 aa  182  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0547463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  33.81 
 
 		 587 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 431 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  44.31 
 
 		 352 aa  182  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 401 aa  182  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 453 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  37.97 
 
 		 591 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 607 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 585 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 442 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 585 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  37.39 
 
 		 443 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 412 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  39.88 
 
 		 391 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  44.05 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  35.61 
 
 		 437 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 439 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 582 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 422 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 590 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>