More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0298 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0298  sensor histidine kinase, putative  100 
 
 
438 aa  882    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0312  putative sensor histidine kinase  99.77 
 
 
438 aa  880    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  80.99 
 
 
430 aa  709    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  56.33 
 
 
424 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  57.01 
 
 
419 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  51.15 
 
 
407 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0167  histidine kinase  55.93 
 
 
407 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114642  normal  0.326562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.06 
 
 
415 aa  359  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  54.08 
 
 
510 aa  352  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  47.52 
 
 
438 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  48.7 
 
 
433 aa  328  9e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.97 
 
 
445 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  47.2 
 
 
451 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  48.24 
 
 
450 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  48.96 
 
 
417 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.85 
 
 
449 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  48.67 
 
 
435 aa  306  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  49.86 
 
 
363 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.15 
 
 
423 aa  299  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.41 
 
 
422 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  46.71 
 
 
443 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2916  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.66 
 
 
430 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.301233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.49 
 
 
448 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2689  histidine kinase  48.66 
 
 
430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  47.81 
 
 
356 aa  286  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  47.06 
 
 
346 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 
346 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  43.35 
 
 
346 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4551  histidine kinase  42.42 
 
 
480 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.86 
 
 
350 aa  239  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 
346 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
478 aa  237  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0478  histidine kinase  37.85 
 
 
438 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1535  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
459 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.896315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2689  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10288  normal  0.570693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1263  histidine kinase  42.39 
 
 
346 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2275  histidine kinase  35.55 
 
 
394 aa  196  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0585084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
456 aa  195  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
444 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1532  histidine kinase  50.42 
 
 
353 aa  193  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.628543  normal  0.374808 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
449 aa  189  9e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  43.5 
 
 
439 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
458 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  44.12 
 
 
352 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
585 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
439 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
439 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
482 aa  186  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
439 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
585 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  42.04 
 
 
439 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  42.04 
 
 
439 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 
431 aa  179  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
432 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  44.19 
 
 
446 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 
464 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
412 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 
440 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  35.38 
 
 
434 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  40.5 
 
 
587 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  40.5 
 
 
587 aa  176  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
581 aa  176  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
412 aa  176  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1287  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 
468 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  41.46 
 
 
436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  40.5 
 
 
587 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  40.5 
 
 
587 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  41.46 
 
 
436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  41.46 
 
 
436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
815 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  41.46 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  40.5 
 
 
587 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  40.5 
 
 
587 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  41.46 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
582 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  37.6 
 
 
346 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  41.34 
 
 
448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
587 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1435  phosphate regulon sensor protein PhoR  33.1 
 
 
442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  41.46 
 
 
436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3104  histidine protein kinase PhoR  40.74 
 
 
438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0547463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  33.94 
 
 
587 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  33.94 
 
 
587 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  36.33 
 
 
598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
422 aa  174  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
439 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  33.94 
 
 
587 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
590 aa  173  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  41.06 
 
 
436 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2179  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 
450 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  35.56 
 
 
565 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
589 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
401 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 
442 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
607 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
445 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>