More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1535 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1535  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 459 aa  902    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.896315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 478 aa  266  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2689  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 		 402 aa  246  6.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10288  normal  0.570693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  45.4 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 		 445 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 		 423 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  43.13 
 
 		 433 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  45.21 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  43.63 
 
 		 356 aa  240  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 		 422 aa  239  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  45.87 
 
 		 443 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  44.58 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  43.8 
 
 		 346 aa  233  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 417 aa  233  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  42.82 
 
 		 450 aa  232  9e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  45.85 
 
 		 363 aa  230  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  44.98 
 
 		 435 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  52.48 
 
 		 510 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2689  histidine kinase  42.42 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0298  sensor histidine kinase, putative  42.24 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0312  putative sensor histidine kinase  42.24 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2916  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 430 aa  222  9e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.301233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.6 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.2 
 
 		 346 aa  216  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  42.06 
 
 		 419 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1532  histidine kinase  49.8 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.628543  normal  0.374808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  50.8 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  40.62 
 
 		 424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  42.38 
 
 		 407 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0167  histidine kinase  41.99 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114642  normal  0.326562 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1263  histidine kinase  50.8 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0478  histidine kinase  40.73 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4551  histidine kinase  45.13 
 
 		 480 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 458 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 		 412 aa  193  7e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 412 aa  192  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 456 aa  192  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  37.44 
 
 		 591 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 439 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 585 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2275  histidine kinase  46.51 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0585084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 489 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 585 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 607 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 594 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 449 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 482 aa  183  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 608 aa  183  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 590 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 599 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1287  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 468 aa  180  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 590 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 476 aa  179  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3575  histidine kinase  38.98 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455968  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 589 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 587 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 591 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  35.08 
 
 		 587 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 440 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  35.08 
 
 		 587 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  35.08 
 
 		 587 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  35.08 
 
 		 587 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 422 aa  176  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  42.75 
 
 		 430 aa  176  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  34.75 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 595 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  34.43 
 
 		 587 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  36.07 
 
 		 434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  34.43 
 
 		 587 aa  173  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  34.43 
 
 		 587 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  34.43 
 
 		 587 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  39.46 
 
 		 555 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 600 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0472  hypothetical protein  41.6 
 
 		 252 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4401  histidine kinase  42.17 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2258  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.42492 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1717  phosphate regulon sensor protein  41.6 
 
 		 252 aa  172  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0057387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 612 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 433 aa  170  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 465 aa  170  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 582 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1492  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 465 aa  169  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2400  Signal transduction histidine kinase, PhoR  35.76 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.595791  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48530  phosphate regulon histidine protein kinase; PhoR  36.36 
 
 		 440 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.771609  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2215  histidine kinase  41.27 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  31.27 
 
 		 598 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 591 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  35.82 
 
 		 608 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 619 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 608 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>