More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0496 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  100 
 
 		 419 aa  840    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0167  histidine kinase  66.67 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114642  normal  0.326562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  65.54 
 
 		 407 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.23 
 
 		 415 aa  454  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  58.84 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0298  sensor histidine kinase, putative  57.01 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0312  putative sensor histidine kinase  57.01 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  53.21 
 
 		 424 aa  332  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  51.8 
 
 		 510 aa  312  9e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  48.39 
 
 		 451 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.2 
 
 		 449 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  42.12 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.54 
 
 		 448 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 		 445 aa  286  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  47.75 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  45.32 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  42.42 
 
 		 450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  44.88 
 
 		 417 aa  280  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  47.04 
 
 		 356 aa  280  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.47 
 
 		 422 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  45.4 
 
 		 438 aa  275  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2916  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.301233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2689  histidine kinase  45.88 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  44.84 
 
 		 363 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  44.51 
 
 		 478 aa  253  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  42.86 
 
 		 346 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 346 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  43.64 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 346 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0478  histidine kinase  38.4 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4551  histidine kinase  40.56 
 
 		 480 aa  229  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2689  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.42 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10288  normal  0.570693 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1535  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 459 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.896315  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1532  histidine kinase  43.49 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.628543  normal  0.374808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 350 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 489 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1263  histidine kinase  39.71 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3575  histidine kinase  37.98 
 
 		 416 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455968  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 444 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 585 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 468 aa  194  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 456 aa  192  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  34.91 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  39.26 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  39.26 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  39.26 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  39.26 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  39.26 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  39.26 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  39.26 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  44.44 
 
 		 439 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 439 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 439 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 439 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  38.96 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  42.69 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3104  histidine protein kinase PhoR  38.12 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0547463  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 439 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  44.58 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 482 aa  187  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 458 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3135  phosphate regulon sensor protein  35.98 
 
 		 438 aa  186  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  41.7 
 
 		 587 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  41.7 
 
 		 587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 585 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 587 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3275  phosphate regulon sensor protein  35.98 
 
 		 438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3285  phosphate regulon sensor protein  35.98 
 
 		 438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  42.74 
 
 		 439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  42.74 
 
 		 439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  40.85 
 
 		 587 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  40.85 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  40.85 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  40.85 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  40.85 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  40.85 
 
 		 587 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  40.85 
 
 		 587 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 582 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 600 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 590 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 597 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2456  phosphate regulon sensor protein  32.83 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0254  phosphate regulon sensor protein  35.19 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 423 aa  176  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 440 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 612 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 597 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 581 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2275  histidine kinase  46.02 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0585084  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 608 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 607 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0542  histidine kinase  35.09 
 
 		 435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0228  histidine kinase  43.22 
 
 		 438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 584 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>