More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1042 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  100 
 
 		 438 aa  857    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  81.76 
 
 		 433 aa  635    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  69.08 
 
 		 422 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2916  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  61.41 
 
 		 430 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.301233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2689  histidine kinase  61.17 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  61.5 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  51.4 
 
 		 451 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  47.15 
 
 		 450 aa  341  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  52.35 
 
 		 417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_004310  BR0298  sensor histidine kinase, putative  47.41 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0312  putative sensor histidine kinase  48.96 
 
 		 438 aa  335  7e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55 
 
 		 449 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  53.01 
 
 		 363 aa  330  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  53.18 
 
 		 510 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  50.7 
 
 		 356 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  46.32 
 
 		 430 aa  318  7.999999999999999e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  48.51 
 
 		 443 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  49.49 
 
 		 435 aa  316  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.94 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.65 
 
 		 415 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 		 445 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  44.76 
 
 		 407 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0167  histidine kinase  47.62 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114642  normal  0.326562 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  47.7 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  47.38 
 
 		 478 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  45.4 
 
 		 419 aa  282  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  46.73 
 
 		 424 aa  282  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.08 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.97 
 
 		 346 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  46.78 
 
 		 346 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.67 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0478  histidine kinase  40.76 
 
 		 438 aa  252  9.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1535  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.896315  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1263  histidine kinase  46.24 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4551  histidine kinase  41.62 
 
 		 480 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1532  histidine kinase  44.87 
 
 		 353 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.628543  normal  0.374808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 458 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 489 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3575  histidine kinase  41.59 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455968  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 482 aa  206  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2689  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10288  normal  0.570693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2179  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 412 aa  199  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 442 aa  199  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 585 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0868  phosphate regulon sensor protein  37.18 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 		 476 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 448 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  37.76 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  37.76 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3233  phosphate regulon sensor protein  37.76 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  unclonable  0.0000000115446 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0428  phosphate regulon sensor protein  37.76 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0468  phosphate regulon sensor protein  37.76 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  37.76 
 
 		 431 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  37.76 
 
 		 431 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  37.76 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  45.23 
 
 		 352 aa  192  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 453 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0436  phosphate regulon sensor protein  43.5 
 
 		 431 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0455  phosphate regulon sensor protein  43.5 
 
 		 431 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0497  phosphate regulon sensor protein  43.5 
 
 		 431 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0442  phosphate regulon sensor protein  43.5 
 
 		 431 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 449 aa  192  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03439  phosphate regulon sensor protein PhoR  34.31 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  35.27 
 
 		 598 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0436  phosphate regulon sensor protein  43.09 
 
 		 431 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 587 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 585 aa  190  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  33.71 
 
 		 587 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2275  histidine kinase  38.5 
 
 		 394 aa  189  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0585084  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  37.39 
 
 		 434 aa  189  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  33.7 
 
 		 587 aa  189  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  33.7 
 
 		 587 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 433 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  33.91 
 
 		 565 aa  188  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  33.43 
 
 		 587 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  33.42 
 
 		 587 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  33.42 
 
 		 587 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  33.42 
 
 		 587 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  33.43 
 
 		 587 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  33.42 
 
 		 587 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 600 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 439 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 585 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 431 aa  187  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 554 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  32.48 
 
 		 554 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  44.05 
 
 		 443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 581 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2258  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.42492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  38.72 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000310244  normal  0.666466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>