More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2670 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  100 
 
 		 352 aa  698    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3401  histidine kinase  39.1 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.810153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5610  histidine kinase  40.07 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0192  ATP-binding region ATPase domain protein  38.44 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.1922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.28 
 
 		 592 aa  222  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1223  histidine kinase  38.53 
 
 		 368 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0457271  hitchhiker  0.00161967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  42.58 
 
 		 537 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01805  PhoR  44.27 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 		 594 aa  212  9e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0543  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 585 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 		 581 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 		 584 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 587 aa  206  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.37 
 
 		 584 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  43.35 
 
 		 587 aa  205  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  43.35 
 
 		 587 aa  205  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.5 
 
 		 489 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 589 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.15 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 587 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 458 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 585 aa  202  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 582 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  42.49 
 
 		 587 aa  202  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  42.49 
 
 		 587 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  42.49 
 
 		 587 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  42.49 
 
 		 587 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 467 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  42.49 
 
 		 587 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  42.49 
 
 		 587 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  42.49 
 
 		 587 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 		 453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  43.46 
 
 		 581 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3041  two-component sensor histidine kinase, phosphate regulation  36.12 
 
 		 350 aa  196  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.575064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 581 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 		 478 aa  192  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  44.31 
 
 		 435 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 590 aa  192  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  45.23 
 
 		 438 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  44.53 
 
 		 433 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 608 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 		 593 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  43.64 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  45.8 
 
 		 450 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  44.49 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  45.57 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 600 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  44.81 
 
 		 346 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 607 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 		 422 aa  188  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 596 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 482 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  44.58 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0298  sensor histidine kinase, putative  44.12 
 
 		 438 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 487 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0312  putative sensor histidine kinase  44.12 
 
 		 438 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  44.44 
 
 		 510 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  42.98 
 
 		 554 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 554 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  43.28 
 
 		 581 aa  187  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  44.54 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 589 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 456 aa  186  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  40.79 
 
 		 565 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  40.34 
 
 		 598 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  40.08 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 608 aa  184  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  44.44 
 
 		 443 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  44.58 
 
 		 363 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  44.44 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0472  hypothetical protein  40.25 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  44.31 
 
 		 346 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1717  phosphate regulon sensor protein  40.25 
 
 		 252 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0057387  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 473 aa  182  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  42.92 
 
 		 430 aa  182  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0228  histidine kinase  44.94 
 
 		 438 aa  182  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 590 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  44.02 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 437 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  40.35 
 
 		 584 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 571 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 		 631 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 591 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  40.6 
 
 		 431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  38.98 
 
 		 508 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  39.42 
 
 		 431 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  40.68 
 
 		 599 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 448 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  44.58 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>