More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0167 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0167  histidine kinase  100 
 
 		 407 aa  814    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114642  normal  0.326562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  94.1 
 
 		 407 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  64.68 
 
 		 419 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  62.56 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  50.12 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0312  putative sensor histidine kinase  49.63 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0298  sensor histidine kinase, putative  49.63 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  54.52 
 
 		 424 aa  345  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  51.34 
 
 		 510 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  46.55 
 
 		 451 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.43 
 
 		 449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  46.61 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 		 422 aa  299  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2916  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.301233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  46.71 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 		 448 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 445 aa  292  6e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2689  histidine kinase  43.07 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  47.62 
 
 		 438 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  41.65 
 
 		 450 aa  285  7e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  47.08 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  44.71 
 
 		 443 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 423 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  42.11 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 		 346 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 346 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  45.43 
 
 		 363 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  44.48 
 
 		 346 aa  253  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 478 aa  250  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4551  histidine kinase  41.4 
 
 		 480 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0478  histidine kinase  40.17 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1532  histidine kinase  43.15 
 
 		 353 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.628543  normal  0.374808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 		 350 aa  232  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1263  histidine kinase  41.28 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2689  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10288  normal  0.570693 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1535  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 459 aa  212  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.896315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3575  histidine kinase  37.91 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455968  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3104  histidine protein kinase PhoR  38.53 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0547463  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2275  histidine kinase  34.8 
 
 		 394 aa  189  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0585084  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  40.36 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 489 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 482 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  39.58 
 
 		 437 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 440 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 468 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  40.3 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  40.3 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  40.3 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  40.3 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  40.3 
 
 		 436 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  40.3 
 
 		 436 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  40.3 
 
 		 448 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  36.26 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 585 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  39.7 
 
 		 436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 437 aa  183  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  39.51 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  39.51 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 456 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  45.08 
 
 		 446 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 584 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0228  histidine kinase  43.32 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  42.31 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 581 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 584 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 412 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 590 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3135  phosphate regulon sensor protein  35.35 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 612 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3285  phosphate regulon sensor protein  35.35 
 
 		 438 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3275  phosphate regulon sensor protein  35.35 
 
 		 438 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2400  Signal transduction histidine kinase, PhoR  33.51 
 
 		 437 aa  172  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.595791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2258  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.42492 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  42.15 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 592 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  35.87 
 
 		 587 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 585 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  34.56 
 
 		 587 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0254  phosphate regulon sensor protein  33.74 
 
 		 433 aa  170  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  35.92 
 
 		 555 aa  170  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02493  two-component system sensor protein  42.32 
 
 		 442 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  34.76 
 
 		 587 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 442 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  36.36 
 
 		 587 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>