More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1742 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 608 aa  1245    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3601  alginate biosynthesis sensor protein KinB  44.66 
 
 		 626 aa  492  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 610 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 612 aa  281  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 612 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 597 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 577 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  27.27 
 
 		 586 aa  220  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 555 aa  217  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 577 aa  210  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0068  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 604 aa  200  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  26.81 
 
 		 595 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 444 aa  189  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  29.65 
 
 		 595 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 604 aa  188  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  29.65 
 
 		 762 aa  185  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 588 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 608 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 599 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 593 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 592 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 593 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 944 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 589 aa  176  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 489 aa  176  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 581 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 593 aa  174  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  29.22 
 
 		 581 aa  174  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 625 aa  174  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  31.27 
 
 		 595 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 571 aa  171  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 585 aa  171  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0175  alginate biosynthesis sensor protein KinB  29.19 
 
 		 598 aa  169  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  31.7 
 
 		 596 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  28.87 
 
 		 581 aa  167  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 755 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2123  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 688 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.267371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 758 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 584 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 754 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0335  sensory box histidine kinase  31.19 
 
 		 595 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  29.31 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 592 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 460 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 645 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 650 aa  161  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17681  two-component sensor histidine kinase  26.15 
 
 		 689 aa  160  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.335797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  25.97 
 
 		 689 aa  160  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 585 aa  160  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  39.66 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 3470 aa  158  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 600 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 596 aa  157  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0924  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 664 aa  157  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 581 aa  157  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 		 865 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 624 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  27.02 
 
 		 598 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 2783 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  25.74 
 
 		 587 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 498 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 584 aa  154  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  37.34 
 
 		 352 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 587 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 608 aa  154  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 669 aa  154  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00391757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  28.7 
 
 		 591 aa  154  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  37.97 
 
 		 464 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 875 aa  153  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  25.54 
 
 		 587 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  39.08 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  30.5 
 
 		 589 aa  152  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 594 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 885 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.08 
 
 		 607 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15021  two-component sensor histidine kinase  25.88 
 
 		 689 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.1145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 453 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  27.46 
 
 		 584 aa  151  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  38.98 
 
 		 461 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 899 aa  151  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 899 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  24.68 
 
 		 587 aa  150  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 597 aa  150  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 621 aa  150  8e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 2161 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 611 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15271  two-component sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 688 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 590 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  27.07 
 
 		 571 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.62 
 
 		 785 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15421  two-component sensor histidine kinase  25.72 
 
 		 688 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 612 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 585 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 505 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  25.1 
 
 		 587 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 763 aa  148  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  27.97 
 
 		 613 aa  148  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  26.64 
 
 		 571 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>