More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2503 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 586 aa  1192    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.03 
 
 		 566 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0068  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 		 604 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 577 aa  468  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 		 555 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 577 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 612 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 612 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 610 aa  226  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 608 aa  194  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 		 593 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3601  alginate biosynthesis sensor protein KinB  24.68 
 
 		 626 aa  183  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  27.25 
 
 		 762 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 754 aa  180  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 755 aa  179  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  30.6 
 
 		 617 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 597 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 944 aa  174  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 899 aa  173  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 899 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 591 aa  171  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 758 aa  171  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.08 
 
 		 444 aa  170  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 752 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 581 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 593 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  25.79 
 
 		 581 aa  167  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 763 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 597 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  25.11 
 
 		 581 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 584 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 597 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 		 593 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  23.25 
 
 		 595 aa  163  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 953 aa  162  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 3470 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 611 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  25.34 
 
 		 613 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 619 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 594 aa  160  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 		 593 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.35 
 
 		 592 aa  160  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1602  sensor histidine kinase ResE  29.89 
 
 		 591 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144012  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0924  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 664 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1638  sensor histidine kinase ResE  29.89 
 
 		 591 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17681  two-component sensor histidine kinase  24.66 
 
 		 689 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.335797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 608 aa  158  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  25.34 
 
 		 613 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 958 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  25.34 
 
 		 613 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 604 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  25.34 
 
 		 613 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  24.66 
 
 		 689 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05451  two-component sensor histidine kinase  23.44 
 
 		 685 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1360  sensor histidine kinase  29.66 
 
 		 591 aa  157  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000268966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1359  sensor histidine kinase  29.66 
 
 		 591 aa  157  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.805336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1570  sensor histidine kinase ResE  29.66 
 
 		 591 aa  157  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4159100000000003e-40 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1387  sensor histidine kinase ResE  29.21 
 
 		 591 aa  156  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 645 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1498  sensor histidine kinase ResE  29.21 
 
 		 591 aa  156  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000125371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  25.11 
 
 		 613 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 634 aa  156  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3813  sensor histidine kinase ResE  29.44 
 
 		 591 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000821443  hitchhiker  2.81471e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  25.11 
 
 		 613 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  25.11 
 
 		 613 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  25.11 
 
 		 613 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  23.25 
 
 		 595 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  25.11 
 
 		 613 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1532  sensor histidine kinase ResE  29.44 
 
 		 591 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0525759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  22.75 
 
 		 596 aa  154  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  26.56 
 
 		 591 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 588 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 571 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  25.11 
 
 		 598 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 589 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 		 658 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.826724 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15421  two-component sensor histidine kinase  23 
 
 		 688 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 597 aa  151  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2891  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 615 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.031526 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 590 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15271  two-component sensor histidine kinase  23.3 
 
 		 688 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1439  two-component sensor histidine kinase  22.81 
 
 		 689 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 596 aa  150  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 		 590 aa  150  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 589 aa  150  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.92 
 
 		 906 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0175  alginate biosynthesis sensor protein KinB  23.4 
 
 		 598 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  26.6 
 
 		 1629 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 591 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 640 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 600 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15021  two-component sensor histidine kinase  22.77 
 
 		 689 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.1145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.08 
 
 		 456 aa  148  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  25.12 
 
 		 595 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 585 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 592 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 571 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 		 799 aa  146  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 		 612 aa  146  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>