More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0057 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
593 aa  1194    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.87 
 
 
733 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.05 
 
 
577 aa  173  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
612 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 
555 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 
612 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  23.28 
 
 
586 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 
566 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0068  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.7 
 
 
604 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 
577 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 
597 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
597 aa  133  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
591 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0175  alginate biosynthesis sensor protein KinB  27.59 
 
 
598 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
582 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 
453 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
678 aa  126  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  25.99 
 
 
596 aa  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
597 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
600 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  25 
 
 
595 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  26.79 
 
 
595 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
621 aa  120  7.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
593 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1387  sensor histidine kinase ResE  25.92 
 
 
591 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1498  sensor histidine kinase ResE  25.92 
 
 
591 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000125371  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
585 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
979 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0335  sensory box histidine kinase  26.42 
 
 
595 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
556 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1359  sensor histidine kinase  25.92 
 
 
591 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.805336  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
799 aa  118  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 
458 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
556 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1602  sensor histidine kinase ResE  25.92 
 
 
591 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144012  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
489 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1638  sensor histidine kinase ResE  25.92 
 
 
591 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  24.61 
 
 
595 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1570  sensor histidine kinase ResE  25.92 
 
 
591 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4159100000000003e-40 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1360  sensor histidine kinase  25.92 
 
 
591 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000268966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
829 aa  117  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 
456 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
591 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3813  sensor histidine kinase ResE  25.69 
 
 
591 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000821443  hitchhiker  2.81471e-19 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 
609 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1532  sensor histidine kinase ResE  25.69 
 
 
591 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0525759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
418 aa  115  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.91 
 
 
865 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 
412 aa  115  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
639 aa  115  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
1039 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  23.33 
 
 
613 aa  114  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
827 aa  114  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
620 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 
611 aa  113  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 
612 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 
592 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
1207 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
602 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 
585 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 
619 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 
738 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  33.06 
 
 
409 aa  110  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
614 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.82 
 
 
594 aa  110  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.61 
 
 
1348 aa  110  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
359 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.43 
 
 
944 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
592 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  30.34 
 
 
799 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 
460 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
422 aa  110  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 
634 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 
608 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1871  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
842 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464371  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
606 aa  109  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 
571 aa  109  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 
588 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
412 aa  108  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  33.33 
 
 
347 aa  108  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.2 
 
 
621 aa  108  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  25.54 
 
 
762 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
604 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 
484 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
553 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.92854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 
593 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 
839 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 
640 aa  107  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
949 aa  107  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
440 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  29.6 
 
 
470 aa  107  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 
556 aa  107  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3930  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
342 aa  107  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0182336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
624 aa  107  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  22.17 
 
 
599 aa  107  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.32 
 
 
1021 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
601 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>