More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3601 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3601  alginate biosynthesis sensor protein KinB  100 
 
 
626 aa  1256    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 
608 aa  489  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
610 aa  356  5.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
612 aa  271  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
612 aa  259  9e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
597 aa  205  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
555 aa  199  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0068  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
604 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  24.68 
 
 
586 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  27.57 
 
 
595 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  26.71 
 
 
595 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0175  alginate biosynthesis sensor protein KinB  29.32 
 
 
598 aa  178  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
577 aa  177  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  30 
 
 
596 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 
593 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
593 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
589 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 
577 aa  172  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
458 aa  171  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
588 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
592 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  27.66 
 
 
595 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
444 aa  165  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
608 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 
566 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 
581 aa  163  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0335  sensory box histidine kinase  28.48 
 
 
595 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  28.51 
 
 
762 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2123  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
688 aa  159  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.267371  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  27.21 
 
 
581 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
604 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15021  two-component sensor histidine kinase  27.06 
 
 
689 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.1145  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
599 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
456 aa  153  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  27.99 
 
 
581 aa  153  8e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1439  two-component sensor histidine kinase  26.64 
 
 
689 aa  153  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
489 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15271  two-component sensor histidine kinase  26.79 
 
 
688 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15421  two-component sensor histidine kinase  27 
 
 
688 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13951  two-component sensor histidine kinase  26.41 
 
 
686 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0290244  normal  0.899353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
645 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 
799 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
594 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
593 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
752 aa  147  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  27.05 
 
 
598 aa  147  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 
944 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  34.03 
 
 
617 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  25.59 
 
 
689 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
453 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 
600 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
3470 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 
585 aa  145  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17681  two-component sensor histidine kinase  25.59 
 
 
689 aa  144  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.335797  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
650 aa  144  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
370 aa  143  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
571 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 
592 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
885 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
581 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
549 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
607 aa  140  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
590 aa  140  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0924  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
664 aa  140  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
597 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 
591 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 
597 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  26.03 
 
 
587 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  26.03 
 
 
587 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05451  two-component sensor histidine kinase  27.2 
 
 
685 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
758 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  25.84 
 
 
587 aa  138  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
725 aa  138  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
755 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 
696 aa  137  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.472328  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
595 aa  137  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  27.36 
 
 
537 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
483 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
2783 aa  137  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
625 aa  136  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  25.84 
 
 
587 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
546 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
754 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
621 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 
587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  25.34 
 
 
587 aa  135  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  25.34 
 
 
587 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  25.34 
 
 
587 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
619 aa  135  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
582 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
608 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
509 aa  134  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
669 aa  134  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00391757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  33.47 
 
 
461 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
592 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  25.62 
 
 
587 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
611 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>