More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0336 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 612 aa  1249    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 612 aa  392  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 608 aa  269  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  30.55 
 
 		 595 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  31.06 
 
 		 595 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3601  alginate biosynthesis sensor protein KinB  31.25 
 
 		 626 aa  247  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 577 aa  245  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 593 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 588 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0335  sensory box histidine kinase  29.36 
 
 		 595 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 593 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  29.14 
 
 		 595 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 592 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  27.08 
 
 		 586 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  28.55 
 
 		 596 aa  231  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 566 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0068  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 604 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 555 aa  224  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0175  alginate biosynthesis sensor protein KinB  32.57 
 
 		 598 aa  217  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 577 aa  216  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 489 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 593 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  32.14 
 
 		 581 aa  211  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 594 aa  209  9e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 758 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  31.47 
 
 		 581 aa  207  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  29.79 
 
 		 762 aa  206  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 597 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 597 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 591 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 754 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 755 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 599 aa  204  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 444 aa  204  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 596 aa  203  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 581 aa  201  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 453 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 589 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 571 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 607 aa  196  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 608 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 645 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 590 aa  194  6e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 585 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0924  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 664 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 604 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  32.61 
 
 		 537 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1387  sensor histidine kinase ResE  31.15 
 
 		 591 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1498  sensor histidine kinase ResE  31.15 
 
 		 591 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000125371  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 590 aa  190  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1638  sensor histidine kinase ResE  30.91 
 
 		 591 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1602  sensor histidine kinase ResE  30.91 
 
 		 591 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144012  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 597 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 600 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 609 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 669 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00391757  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3813  sensor histidine kinase ResE  30.91 
 
 		 591 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000821443  hitchhiker  2.81471e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1532  sensor histidine kinase ResE  31.15 
 
 		 591 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0525759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1360  sensor histidine kinase  30.91 
 
 		 591 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000268966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1359  sensor histidine kinase  30.91 
 
 		 591 aa  189  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.805336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1570  sensor histidine kinase ResE  30.91 
 
 		 591 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4159100000000003e-40 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 621 aa  188  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 582 aa  188  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 621 aa  187  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 612 aa  187  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 650 aa  187  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 885 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 1319 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  29.59 
 
 		 598 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  30.09 
 
 		 565 aa  184  6e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  29.53 
 
 		 613 aa  184  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 2161 aa  183  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 2153 aa  183  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 592 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 623 aa  183  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 752 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 619 aa  182  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 597 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  28.11 
 
 		 591 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 584 aa  180  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 711 aa  180  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 763 aa  179  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  29.3 
 
 		 613 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 584 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 613 aa  179  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 613 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  29.53 
 
 		 613 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  29.53 
 
 		 613 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 587 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 590 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  29.53 
 
 		 613 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  28.17 
 
 		 689 aa  178  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  29.53 
 
 		 613 aa  178  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  29.53 
 
 		 613 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>