More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2621 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 610 aa  1223    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 608 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3601  alginate biosynthesis sensor protein KinB  37.77 
 
 		 626 aa  339  7e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 612 aa  292  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 612 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 597 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0068  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 604 aa  227  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  26.4 
 
 		 586 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 555 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 577 aa  219  8.999999999999998e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 566 aa  216  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  32.8 
 
 		 595 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 599 aa  201  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  32.96 
 
 		 595 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 604 aa  194  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 596 aa  193  9e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  32.75 
 
 		 595 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 600 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 588 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 619 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0335  sensory box histidine kinase  32.59 
 
 		 595 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 571 aa  191  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  30.09 
 
 		 613 aa  191  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0175  alginate biosynthesis sensor protein KinB  32.21 
 
 		 598 aa  189  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 593 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 611 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 593 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 592 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  30.09 
 
 		 613 aa  187  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  29.86 
 
 		 613 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 594 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  29.64 
 
 		 613 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  29.86 
 
 		 613 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 613 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 613 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  29.86 
 
 		 613 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  29.86 
 
 		 613 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  31.75 
 
 		 596 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  30.3 
 
 		 581 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 885 aa  183  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 752 aa  183  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 589 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 571 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  28.47 
 
 		 587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 		 608 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 609 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  28.47 
 
 		 587 aa  181  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  28.47 
 
 		 587 aa  181  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 763 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  28.47 
 
 		 587 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  28.47 
 
 		 587 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  28.47 
 
 		 587 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  28.47 
 
 		 587 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 592 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 608 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 444 aa  180  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 585 aa  180  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  28.47 
 
 		 587 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  31.19 
 
 		 537 aa  179  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  29.93 
 
 		 581 aa  177  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  28.25 
 
 		 587 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 754 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 582 aa  177  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 581 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 591 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1439  two-component sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 689 aa  174  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15421  two-component sensor histidine kinase  29.35 
 
 		 688 aa  174  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  29.71 
 
 		 584 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15271  two-component sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 688 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 755 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 590 aa  172  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 593 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 597 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2123  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 688 aa  170  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.267371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 597 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  29.52 
 
 		 762 aa  170  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 590 aa  170  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  40.42 
 
 		 617 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 581 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 597 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 758 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  28.47 
 
 		 598 aa  169  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 899 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 612 aa  168  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15021  two-component sensor histidine kinase  28.7 
 
 		 689 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.1145  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 608 aa  167  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1387  sensor histidine kinase ResE  30 
 
 		 591 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1498  sensor histidine kinase ResE  30 
 
 		 591 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000125371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 607 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 584 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 587 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1776  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 710 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.548217  normal  0.563692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 584 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>