More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0047 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  70.1 
 
 		 593 aa  804    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  71.14 
 
 		 592 aa  842    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0335  sensory box histidine kinase  75.97 
 
 		 595 aa  851    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  75.17 
 
 		 595 aa  853    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  100 
 
 		 596 aa  1192    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  70.44 
 
 		 593 aa  811    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  71.28 
 
 		 588 aa  801    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  57.93 
 
 		 595 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  56.81 
 
 		 595 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0175  alginate biosynthesis sensor protein KinB  54.67 
 
 		 598 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 612 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 489 aa  224  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 612 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 594 aa  207  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 581 aa  195  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 610 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 597 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 581 aa  190  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  29.31 
 
 		 762 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  29.54 
 
 		 581 aa  188  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 458 aa  187  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 577 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 604 aa  184  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 608 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 600 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 608 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 587 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 581 aa  182  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 677 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 589 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 453 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 597 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 607 aa  177  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 609 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 599 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 590 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  28.13 
 
 		 608 aa  173  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 		 608 aa  173  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  28.75 
 
 		 598 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 885 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 592 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 763 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 621 aa  172  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 621 aa  172  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 597 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0068  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 		 604 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 758 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  27.69 
 
 		 610 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 589 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3601  alginate biosynthesis sensor protein KinB  27.02 
 
 		 626 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 596 aa  169  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 590 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 591 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 608 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 591 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  32.15 
 
 		 537 aa  166  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 611 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 612 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  27.33 
 
 		 571 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 571 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  27.33 
 
 		 571 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 582 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 623 aa  166  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17681  two-component sensor histidine kinase  29.34 
 
 		 689 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.335797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 597 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  29.34 
 
 		 689 aa  165  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 584 aa  163  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 571 aa  163  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13951  two-component sensor histidine kinase  28.42 
 
 		 686 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0290244  normal  0.899353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  22.75 
 
 		 586 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 608 aa  163  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  29.86 
 
 		 584 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 619 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 534 aa  161  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  29.65 
 
 		 613 aa  161  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  31.24 
 
 		 591 aa  160  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 752 aa  160  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  27.03 
 
 		 565 aa  160  7e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 585 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 637 aa  160  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 556 aa  160  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 577 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 645 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 556 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 590 aa  158  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 584 aa  157  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 606 aa  157  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  27.93 
 
 		 554 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 554 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1002 aa  156  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1359  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 591 aa  156  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.805336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 754 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 		 566 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3813  sensor histidine kinase ResE  29.86 
 
 		 591 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000821443  hitchhiker  2.81471e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1498  sensor histidine kinase ResE  30.57 
 
 		 591 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000125371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  26.12 
 
 		 599 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>