More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1645 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 906 aa  1832    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  80.92 
 
 		 894 aa  1380    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.12 
 
 		 875 aa  725    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 880 aa  574  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.17 
 
 		 1058 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  43.07 
 
 		 576 aa  207  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 		 568 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.88 
 
 		 687 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 905 aa  199  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  40.74 
 
 		 565 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 792 aa  197  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 646 aa  195  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  45.82 
 
 		 482 aa  194  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 767 aa  194  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 		 1977 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 		 780 aa  191  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 911 aa  191  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 		 841 aa  191  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 1877 aa  190  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  40.07 
 
 		 461 aa  189  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  41.64 
 
 		 810 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  41 
 
 		 969 aa  188  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  40.13 
 
 		 464 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.12 
 
 		 893 aa  186  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  40.27 
 
 		 461 aa  185  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  41.05 
 
 		 998 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.7 
 
 		 781 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  40.27 
 
 		 461 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.96 
 
 		 754 aa  183  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 		 1322 aa  183  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 1046 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 1548 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 1287 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  41.67 
 
 		 737 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  40.35 
 
 		 629 aa  181  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 844 aa  181  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.97 
 
 		 1352 aa  181  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  29.97 
 
 		 1361 aa  181  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 		 745 aa  180  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 456 aa  180  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.02 
 
 		 717 aa  180  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 546 aa  180  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 523 aa  180  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  39.84 
 
 		 617 aa  179  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 937 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 		 1274 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 		 823 aa  179  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  40.7 
 
 		 1407 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 1002 aa  178  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 371 aa  178  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 1433 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 		 896 aa  178  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.91 
 
 		 657 aa  178  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 1080 aa  178  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 		 770 aa  177  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 1578 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 636 aa  177  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 798 aa  177  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.54 
 
 		 882 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 1611 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 		 1362 aa  177  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 881 aa  177  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2558  histidine kinase  39.79 
 
 		 397 aa  177  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 		 773 aa  177  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 		 752 aa  177  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  41.94 
 
 		 810 aa  177  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2452  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.14 
 
 		 1177 aa  177  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  42.44 
 
 		 922 aa  177  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 827 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  26.88 
 
 		 706 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 569 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 718 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  40.74 
 
 		 927 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  29.25 
 
 		 708 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 575 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  41.58 
 
 		 661 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 		 970 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 758 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 		 1177 aa  176  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 		 755 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 950 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 		 1193 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 		 1193 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 763 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 		 907 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 404 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  37.64 
 
 		 1133 aa  175  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.16 
 
 		 650 aa  175  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 443 aa  175  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 1069 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 925 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 695 aa  174  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.06 
 
 		 853 aa  174  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 		 1363 aa  174  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 		 1039 aa  174  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.15 
 
 		 1310 aa  174  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 631 aa  174  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 940 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.14 
 
 		 713 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 446 aa  174  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>