More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0484 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  78.27 
 
 		 1014 aa  1608    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1017 aa  2043    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 1211 aa  332  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 1174 aa  294  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 2153 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 711 aa  257  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 719 aa  254  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 677 aa  229  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 726 aa  219  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 2161 aa  200  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 958 aa  187  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.97 
 
 		 2783 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 546 aa  183  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.66 
 
 		 1319 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 885 aa  171  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  31.06 
 
 		 762 aa  170  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 612 aa  170  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 911 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 508 aa  168  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 556 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 905 aa  168  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 944 aa  168  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 639 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 641 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 639 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 639 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 718 aa  164  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 722 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 556 aa  162  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 933 aa  162  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 701 aa  161  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 592 aa  161  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5362  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 643 aa  160  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 508 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 1042 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  34.21 
 
 		 617 aa  159  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 695 aa  159  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 754 aa  158  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 1039 aa  158  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 3470 aa  158  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 758 aa  158  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 815 aa  157  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 		 880 aa  157  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  29.38 
 
 		 595 aa  157  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 612 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 1002 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1399  two component sensor histidine kinase  29.32 
 
 		 565 aa  154  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 511 aa  154  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 509 aa  153  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 687 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 637 aa  151  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 1629 aa  151  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 763 aa  151  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  29.82 
 
 		 516 aa  151  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 875 aa  150  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 571 aa  150  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 893 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1776  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 710 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.548217  normal  0.563692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 755 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 892 aa  149  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 		 725 aa  149  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 906 aa  149  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1021 aa  149  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0175  alginate biosynthesis sensor protein KinB  28.93 
 
 		 598 aa  149  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 392 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 957 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1026 aa  148  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 546 aa  148  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  31.81 
 
 		 589 aa  148  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 456 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3340  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 557 aa  147  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 827 aa  147  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 371 aa  147  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 		 524 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 876 aa  147  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 1291 aa  147  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 396 aa  146  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 916 aa  146  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  32.78 
 
 		 729 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 620 aa  146  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  37.02 
 
 		 482 aa  146  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 894 aa  146  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  29.1 
 
 		 595 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 430 aa  146  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000024984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 470 aa  145  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2460  histidine kinase  39.24 
 
 		 415 aa  145  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 718 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 1060 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3109  sensor protein  37.5 
 
 		 485 aa  145  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 		 780 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 763 aa  145  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 608 aa  145  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 590 aa  145  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 593 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 593 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 475 aa  144  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  35.9 
 
 		 531 aa  144  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 763 aa  144  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1615  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 		 766 aa  144  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0544593  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 488 aa  144  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>