More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2189 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  100 
 
 
482 aa  971    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.57 
 
 
687 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
497 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.63 
 
 
977 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0265  histidine kinase  45.35 
 
 
716 aa  210  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.32 
 
 
755 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.08 
 
 
780 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  40.62 
 
 
576 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 
970 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  42.68 
 
 
1046 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.58 
 
 
974 aa  203  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 
969 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.08 
 
 
975 aa  200  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3384  Signal transduction histidine kinase-like  42.47 
 
 
761 aa  200  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
917 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
456 aa  199  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 
371 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  45 
 
 
729 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  43.58 
 
 
508 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 
894 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
906 aa  196  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  41.9 
 
 
565 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
763 aa  194  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.87 
 
 
853 aa  192  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.02 
 
 
1284 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
569 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  41.92 
 
 
1407 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 
875 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.15 
 
 
791 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
858 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
775 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
646 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
523 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  41.48 
 
 
771 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 
841 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 
769 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 
881 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
940 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
395 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.39 
 
 
631 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 
1058 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 
880 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
1319 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 
704 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 
1021 aa  186  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  44.08 
 
 
1135 aa  186  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.63 
 
 
1007 aa  186  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  40.93 
 
 
910 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  38.91 
 
 
998 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  37.7 
 
 
845 aa  186  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 
921 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0404  Signal transduction histidine kinase-like  42 
 
 
498 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 
502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
568 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 
1310 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.92 
 
 
916 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
882 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 
682 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.85 
 
 
717 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.95 
 
 
887 aa  184  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 
995 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 
1877 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
1271 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.42 
 
 
1002 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 
1691 aa  184  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
575 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  42.75 
 
 
641 aa  183  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
779 aa  183  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 
1116 aa  182  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 
1120 aa  183  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 
765 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 
600 aa  182  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  39.29 
 
 
771 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 
546 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 
784 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  41.06 
 
 
923 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2838  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 
860 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
1172 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 
1326 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
911 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  41.37 
 
 
751 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 
833 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  42.69 
 
 
977 aa  182  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.56 
 
 
957 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
631 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
1765 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 
846 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.37 
 
 
1582 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 
1596 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
844 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  37.72 
 
 
1053 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
743 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
775 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 
1350 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 
801 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.06 
 
 
1165 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
1768 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  37.25 
 
 
1070 aa  180  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 
1362 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
770 aa  180  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>