More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3384 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3384  Signal transduction histidine kinase-like  100 
 
 		 761 aa  1554    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 		 1057 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0404  Signal transduction histidine kinase-like  43.82 
 
 		 498 aa  191  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 646 aa  188  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  43.53 
 
 		 482 aa  188  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 767 aa  183  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  34.41 
 
 		 461 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  38.25 
 
 		 565 aa  179  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 		 687 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  34.41 
 
 		 461 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  34.41 
 
 		 461 aa  178  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  39.71 
 
 		 629 aa  177  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 		 1352 aa  177  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 844 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 		 763 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 		 970 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 785 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  45.3 
 
 		 1046 aa  172  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 		 841 aa  170  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  38.16 
 
 		 710 aa  170  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0905538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2911  Signal transduction histidine kinase-like  37.31 
 
 		 614 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 911 aa  170  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 1877 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0496  histidine kinase  41.15 
 
 		 554 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434752 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  40.25 
 
 		 790 aa  168  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 607 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  27.34 
 
 		 1093 aa  167  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 484 aa  167  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 		 975 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  37.09 
 
 		 556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 1362 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 1126 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 		 1274 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 568 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 587 aa  165  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 1131 aa  165  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  40.78 
 
 		 982 aa  164  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  40.08 
 
 		 528 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3871  putative sensor histidine kinase  26.97 
 
 		 788 aa  164  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  33.69 
 
 		 810 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.04 
 
 		 929 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  39.59 
 
 		 1153 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 772 aa  164  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  41.74 
 
 		 729 aa  164  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 1611 aa  164  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  38.52 
 
 		 918 aa  163  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 918 aa  163  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  38.52 
 
 		 918 aa  163  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.52 
 
 		 918 aa  163  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.52 
 
 		 918 aa  163  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.52 
 
 		 918 aa  163  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.52 
 
 		 918 aa  163  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.52 
 
 		 918 aa  163  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.52 
 
 		 918 aa  163  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 875 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 770 aa  163  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  41.25 
 
 		 1361 aa  163  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  36.84 
 
 		 576 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 490 aa  162  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  41.13 
 
 		 685 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  39.23 
 
 		 560 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 882 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 633 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 1029 aa  162  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 775 aa  162  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 569 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  38.02 
 
 		 998 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 906 aa  161  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.13 
 
 		 918 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.13 
 
 		 918 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.13 
 
 		 918 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.13 
 
 		 918 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 791 aa  161  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.37 
 
 		 929 aa  161  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  37.35 
 
 		 464 aa  161  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 774 aa  161  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 880 aa  161  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 784 aa  160  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.04 
 
 		 918 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 1195 aa  160  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 1194 aa  160  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 974 aa  160  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 627 aa  160  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 		 823 aa  160  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  38.37 
 
 		 845 aa  160  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  37.98 
 
 		 1323 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 371 aa  160  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 691 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 		 676 aa  160  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 1622 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  37.35 
 
 		 773 aa  160  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 989 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 		 989 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  36.47 
 
 		 1028 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1284 aa  159  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  36.06 
 
 		 548 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 577 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 1350 aa  159  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 1578 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.86 
 
 		 918 aa  159  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>