More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2911 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2911  Signal transduction histidine kinase-like  100 
 
 		 614 aa  1249    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3723  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 903 aa  280  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.803649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  33.5 
 
 		 891 aa  273  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 		 944 aa  211  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0404  Signal transduction histidine kinase-like  44.54 
 
 		 498 aa  206  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 770 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 823 aa  181  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 		 939 aa  180  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 		 1159 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  42.21 
 
 		 982 aa  178  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.81 
 
 		 1691 aa  178  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  41.7 
 
 		 629 aa  177  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 970 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 791 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.56 
 
 		 721 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 		 395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 1582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29290  hybrid histidine protein kinase  38.39 
 
 		 826 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 977 aa  175  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  38.44 
 
 		 1763 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 631 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  42.47 
 
 		 810 aa  174  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.44 
 
 		 1177 aa  174  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 		 1323 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 792 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  41.31 
 
 		 1323 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 456 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 1038 aa  173  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 827 aa  173  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 1362 aa  173  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  37.54 
 
 		 781 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 		 1350 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 		 917 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  40.38 
 
 		 823 aa  173  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  35.56 
 
 		 998 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 		 780 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  41.92 
 
 		 1200 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  42.4 
 
 		 1560 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 575 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 		 1003 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.36 
 
 		 1203 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 1143 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  40.71 
 
 		 882 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.61 
 
 		 659 aa  170  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  37.68 
 
 		 1361 aa  170  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 		 687 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 		 1068 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.96 
 
 		 841 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  41.91 
 
 		 1046 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 		 858 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.43 
 
 		 1155 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3384  Signal transduction histidine kinase-like  37.31 
 
 		 761 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 		 750 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  36.26 
 
 		 925 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.35 
 
 		 762 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 490 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 		 975 aa  169  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  40.07 
 
 		 853 aa  169  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 443 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  39.84 
 
 		 576 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.8 
 
 		 1410 aa  169  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.02 
 
 		 1309 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 782 aa  169  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 		 1075 aa  169  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  35.96 
 
 		 925 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  39.06 
 
 		 1765 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 		 1201 aa  168  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 569 aa  168  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 685 aa  168  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  40.17 
 
 		 1175 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 		 784 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 646 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 882 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 		 1792 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 989 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 974 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 568 aa  167  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 		 765 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 		 592 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.67 
 
 		 1158 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 		 921 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  40.7 
 
 		 923 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 1768 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  33.83 
 
 		 910 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.67 
 
 		 863 aa  167  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 		 1149 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 574 aa  167  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  43.28 
 
 		 603 aa  167  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 927 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 923 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  37.68 
 
 		 482 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 		 1782 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 1407 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 		 1784 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 		 1786 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.21 
 
 		 956 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 667 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 1771 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  35.65 
 
 		 942 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>